Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Herc3A6H6S0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Herc3A6H6S0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herc3A6H6S0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.2 ms