Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatsperbA2RTF1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatsperbA2RTF1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatsperbA2RTF1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms