Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upf2A2AT37 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Upf2A2AT37 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Upf2A2AT37 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms