Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930447F04RikA2AFR2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930447F04RikA2AFR2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1206.5 ms