Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r10W4VSP8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vmn1r10W4VSP8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Vmn1r10W4VSP8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r10W4VSP8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r10W4VSP8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vmn1r10W4VSP8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r10W4VSP8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn1r10W4VSP8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn1r10W4VSP8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r10W4VSP8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vmn1r10W4VSP8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vmn1r10W4VSP8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vmn1r10W4VSP8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vmn1r10W4VSP8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn1r10W4VSP8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r10W4VSP8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn1r10W4VSP8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r10W4VSP8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vmn1r10W4VSP8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn1r10W4VSP8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r10W4VSP8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r10W4VSP8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r10W4VSP8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r10W4VSP8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r10W4VSP8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vmn1r10W4VSP8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r10W4VSP8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r10W4VSP8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r10W4VSP8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r10W4VSP8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r10W4VSP8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r10W4VSP8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r10W4VSP8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r10W4VSP8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r10W4VSP8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r10W4VSP8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r10W4VSP8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r10W4VSP8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r10W4VSP8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r10W4VSP8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r10W4VSP8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r10W4VSP8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r10W4VSP8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r10W4VSP8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r10W4VSP8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r10W4VSP8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r10W4VSP8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r10W4VSP8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r10W4VSP8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r10W4VSP8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn1r10W4VSP8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r10W4VSP8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r10W4VSP8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn1r10W4VSP8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r10W4VSP8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vmn1r10W4VSP8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r10W4VSP8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r10W4VSP8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r10W4VSP8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vmn1r10W4VSP8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r10W4VSP8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn1r10W4VSP8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r10W4VSP8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r10W4VSP8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r10W4VSP8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vmn1r10W4VSP8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r10W4VSP8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r10W4VSP8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r10W4VSP8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn1r10W4VSP8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vmn1r10W4VSP8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vmn1r10W4VSP8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vmn1r10W4VSP8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r10W4VSP8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn1r10W4VSP8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn1r10W4VSP8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r10W4VSP8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r10W4VSP8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r10W4VSP8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r10W4VSP8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r10W4VSP8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r10W4VSP8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r10W4VSP8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r10W4VSP8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r10W4VSP8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r10W4VSP8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r10W4VSP8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r10W4VSP8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn1r10W4VSP8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn1r10W4VSP8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms