Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsc22d3Q9Z2S7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsc22d3Q9Z2S7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsc22d3Q9Z2S7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsc22d3Q9Z2S7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsc22d3Q9Z2S7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsc22d3Q9Z2S7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsc22d3Q9Z2S7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsc22d3Q9Z2S7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc22d3Q9Z2S7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsc22d3Q9Z2S7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsc22d3Q9Z2S7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc22d3Q9Z2S7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc22d3Q9Z2S7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc22d3Q9Z2S7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsc22d3Q9Z2S7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsc22d3Q9Z2S7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms