Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upk1bQ9Z2C6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upk1bQ9Z2C6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upk1bQ9Z2C6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upk1bQ9Z2C6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upk1bQ9Z2C6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upk1bQ9Z2C6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upk1bQ9Z2C6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Upk1bQ9Z2C6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Upk1bQ9Z2C6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Upk1bQ9Z2C6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upk1bQ9Z2C6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Upk1bQ9Z2C6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upk1bQ9Z2C6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Upk1bQ9Z2C6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Upk1bQ9Z2C6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Upk1bQ9Z2C6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Upk1bQ9Z2C6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Upk1bQ9Z2C6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Upk1bQ9Z2C6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upk1bQ9Z2C6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upk1bQ9Z2C6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upk1bQ9Z2C6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upk1bQ9Z2C6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Upk1bQ9Z2C6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Upk1bQ9Z2C6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upk1bQ9Z2C6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upk1bQ9Z2C6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upk1bQ9Z2C6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Upk1bQ9Z2C6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Upk1bQ9Z2C6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Upk1bQ9Z2C6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upk1bQ9Z2C6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Upk1bQ9Z2C6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upk1bQ9Z2C6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upk1bQ9Z2C6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upk1bQ9Z2C6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Upk1bQ9Z2C6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upk1bQ9Z2C6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upk1bQ9Z2C6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upk1bQ9Z2C6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upk1bQ9Z2C6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upk1bQ9Z2C6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upk1bQ9Z2C6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Upk1bQ9Z2C6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upk1bQ9Z2C6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upk1bQ9Z2C6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upk1bQ9Z2C6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upk1bQ9Z2C6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upk1bQ9Z2C6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upk1bQ9Z2C6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upk1bQ9Z2C6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upk1bQ9Z2C6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upk1bQ9Z2C6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Upk1bQ9Z2C6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upk1bQ9Z2C6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upk1bQ9Z2C6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upk1bQ9Z2C6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upk1bQ9Z2C6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upk1bQ9Z2C6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upk1bQ9Z2C6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upk1bQ9Z2C6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Upk1bQ9Z2C6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upk1bQ9Z2C6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upk1bQ9Z2C6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Upk1bQ9Z2C6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upk1bQ9Z2C6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upk1bQ9Z2C6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upk1bQ9Z2C6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upk1bQ9Z2C6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upk1bQ9Z2C6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upk1bQ9Z2C6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upk1bQ9Z2C6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upk1bQ9Z2C6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upk1bQ9Z2C6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upk1bQ9Z2C6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upk1bQ9Z2C6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upk1bQ9Z2C6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upk1bQ9Z2C6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upk1bQ9Z2C6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upk1bQ9Z2C6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upk1bQ9Z2C6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upk1bQ9Z2C6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upk1bQ9Z2C6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upk1bQ9Z2C6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upk1bQ9Z2C6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upk1bQ9Z2C6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upk1bQ9Z2C6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Upk1bQ9Z2C6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upk1bQ9Z2C6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upk1bQ9Z2C6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upk1bQ9Z2C6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upk1bQ9Z2C6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upk1bQ9Z2C6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms