Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Skp2Q9Z0Z3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Skp2Q9Z0Z3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skp2Q9Z0Z3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skp2Q9Z0Z3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skp2Q9Z0Z3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skp2Q9Z0Z3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skp2Q9Z0Z3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skp2Q9Z0Z3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skp2Q9Z0Z3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skp2Q9Z0Z3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skp2Q9Z0Z3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skp2Q9Z0Z3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skp2Q9Z0Z3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skp2Q9Z0Z3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skp2Q9Z0Z3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skp2Q9Z0Z3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skp2Q9Z0Z3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skp2Q9Z0Z3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skp2Q9Z0Z3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skp2Q9Z0Z3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skp2Q9Z0Z3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skp2Q9Z0Z3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skp2Q9Z0Z3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skp2Q9Z0Z3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skp2Q9Z0Z3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Skp2Q9Z0Z3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skp2Q9Z0Z3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skp2Q9Z0Z3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skp2Q9Z0Z3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skp2Q9Z0Z3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skp2Q9Z0Z3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skp2Q9Z0Z3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skp2Q9Z0Z3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Skp2Q9Z0Z3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skp2Q9Z0Z3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skp2Q9Z0Z3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Skp2Q9Z0Z3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skp2Q9Z0Z3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skp2Q9Z0Z3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skp2Q9Z0Z3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Skp2Q9Z0Z3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skp2Q9Z0Z3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skp2Q9Z0Z3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skp2Q9Z0Z3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skp2Q9Z0Z3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skp2Q9Z0Z3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skp2Q9Z0Z3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skp2Q9Z0Z3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skp2Q9Z0Z3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skp2Q9Z0Z3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Skp2Q9Z0Z3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skp2Q9Z0Z3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skp2Q9Z0Z3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skp2Q9Z0Z3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skp2Q9Z0Z3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Skp2Q9Z0Z3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skp2Q9Z0Z3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skp2Q9Z0Z3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skp2Q9Z0Z3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Skp2Q9Z0Z3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Skp2Q9Z0Z3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skp2Q9Z0Z3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skp2Q9Z0Z3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Skp2Q9Z0Z3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Skp2Q9Z0Z3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skp2Q9Z0Z3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skp2Q9Z0Z3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skp2Q9Z0Z3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skp2Q9Z0Z3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skp2Q9Z0Z3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skp2Q9Z0Z3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skp2Q9Z0Z3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skp2Q9Z0Z3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skp2Q9Z0Z3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Skp2Q9Z0Z3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skp2Q9Z0Z3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skp2Q9Z0Z3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skp2Q9Z0Z3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skp2Q9Z0Z3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Skp2Q9Z0Z3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms