Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf15Q9Z0J7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf15Q9Z0J7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf15Q9Z0J7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf15Q9Z0J7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf15Q9Z0J7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf15Q9Z0J7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf15Q9Z0J7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf15Q9Z0J7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf15Q9Z0J7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf15Q9Z0J7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf15Q9Z0J7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf15Q9Z0J7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf15Q9Z0J7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf15Q9Z0J7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf15Q9Z0J7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf15Q9Z0J7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf15Q9Z0J7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf15Q9Z0J7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf15Q9Z0J7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf15Q9Z0J7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf15Q9Z0J7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf15Q9Z0J7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf15Q9Z0J7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf15Q9Z0J7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf15Q9Z0J7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf15Q9Z0J7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf15Q9Z0J7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf15Q9Z0J7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdf15Q9Z0J7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf15Q9Z0J7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf15Q9Z0J7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf15Q9Z0J7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf15Q9Z0J7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gdf15Q9Z0J7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf15Q9Z0J7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf15Q9Z0J7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf15Q9Z0J7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf15Q9Z0J7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf15Q9Z0J7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf15Q9Z0J7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf15Q9Z0J7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf15Q9Z0J7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf15Q9Z0J7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf15Q9Z0J7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf15Q9Z0J7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf15Q9Z0J7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf15Q9Z0J7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf15Q9Z0J7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf15Q9Z0J7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf15Q9Z0J7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf15Q9Z0J7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf15Q9Z0J7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf15Q9Z0J7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdf15Q9Z0J7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdf15Q9Z0J7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdf15Q9Z0J7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdf15Q9Z0J7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdf15Q9Z0J7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdf15Q9Z0J7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdf15Q9Z0J7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdf15Q9Z0J7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdf15Q9Z0J7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf15Q9Z0J7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf15Q9Z0J7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf15Q9Z0J7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf15Q9Z0J7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf15Q9Z0J7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf15Q9Z0J7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf15Q9Z0J7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms