Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cited4Q9WUL8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cited4Q9WUL8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cited4Q9WUL8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cited4Q9WUL8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cited4Q9WUL8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cited4Q9WUL8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cited4Q9WUL8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cited4Q9WUL8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cited4Q9WUL8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cited4Q9WUL8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cited4Q9WUL8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cited4Q9WUL8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cited4Q9WUL8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cited4Q9WUL8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cited4Q9WUL8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cited4Q9WUL8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cited4Q9WUL8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cited4Q9WUL8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cited4Q9WUL8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cited4Q9WUL8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cited4Q9WUL8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cited4Q9WUL8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cited4Q9WUL8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cited4Q9WUL8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms