Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cited4Q9WUL8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cited4Q9WUL8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cited4Q9WUL8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cited4Q9WUL8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cited4Q9WUL8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cited4Q9WUL8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cited4Q9WUL8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cited4Q9WUL8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cited4Q9WUL8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cited4Q9WUL8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cited4Q9WUL8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cited4Q9WUL8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cited4Q9WUL8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cited4Q9WUL8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cited4Q9WUL8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cited4Q9WUL8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cited4Q9WUL8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cited4Q9WUL8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cited4Q9WUL8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cited4Q9WUL8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cited4Q9WUL8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cited4Q9WUL8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cited4Q9WUL8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cited4Q9WUL8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cited4Q9WUL8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cited4Q9WUL8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cited4Q9WUL8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cited4Q9WUL8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cited4Q9WUL8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cited4Q9WUL8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cited4Q9WUL8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cited4Q9WUL8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cited4Q9WUL8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms