Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H0

Acox1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox1Q9R0H0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Acox1Q9R0H0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Acox1Q9R0H0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Acox1Q9R0H0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Acox1Q9R0H0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Acox1Q9R0H0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Acox1Q9R0H0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acox1Q9R0H0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Acox1Q9R0H0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acox1Q9R0H0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acox1Q9R0H0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Acox1Q9R0H0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acox1Q9R0H0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acox1Q9R0H0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acox1Q9R0H0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Acox1Q9R0H0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Acox1Q9R0H0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acox1Q9R0H0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acox1Q9R0H0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acox1Q9R0H0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acox1Q9R0H0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acox1Q9R0H0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acox1Q9R0H0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acox1Q9R0H0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Acox1Q9R0H0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acox1Q9R0H0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acox1Q9R0H0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Acox1Q9R0H0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acox1Q9R0H0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acox1Q9R0H0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Acox1Q9R0H0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acox1Q9R0H0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acox1Q9R0H0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acox1Q9R0H0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acox1Q9R0H0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Acox1Q9R0H0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acox1Q9R0H0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acox1Q9R0H0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acox1Q9R0H0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acox1Q9R0H0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acox1Q9R0H0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Acox1Q9R0H0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Acox1Q9R0H0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acox1Q9R0H0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Acox1Q9R0H0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Acox1Q9R0H0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acox1Q9R0H0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acox1Q9R0H0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Acox1Q9R0H0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acox1Q9R0H0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Acox1Q9R0H0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acox1Q9R0H0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Acox1Q9R0H0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Acox1Q9R0H0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Acox1Q9R0H0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Acox1Q9R0H0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Acox1Q9R0H0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Acox1Q9R0H0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Acox1Q9R0H0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Acox1Q9R0H0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Acox1Q9R0H0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Acox1Q9R0H0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acox1Q9R0H0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acox1Q9R0H0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acox1Q9R0H0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Acox1Q9R0H0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acox1Q9R0H0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acox1Q9R0H0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acox1Q9R0H0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acox1Q9R0H0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acox1Q9R0H0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Acox1Q9R0H0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acox1Q9R0H0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Acox1Q9R0H0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acox1Q9R0H0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acox1Q9R0H0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acox1Q9R0H0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acox1Q9R0H0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acox1Q9R0H0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acox1Q9R0H0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Acox1Q9R0H0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Acox1Q9R0H0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acox1Q9R0H0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acox1Q9R0H0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acox1Q9R0H0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acox1Q9R0H0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acox1Q9R0H0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Acox1Q9R0H0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Acox1Q9R0H0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acox1Q9R0H0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acox1Q9R0H0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms