Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Copg1Q9QZE5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Copg1Q9QZE5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Copg1Q9QZE5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Copg1Q9QZE5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Copg1Q9QZE5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Copg1Q9QZE5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Copg1Q9QZE5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Copg1Q9QZE5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Copg1Q9QZE5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Copg1Q9QZE5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Copg1Q9QZE5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Copg1Q9QZE5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Copg1Q9QZE5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Copg1Q9QZE5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Copg1Q9QZE5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Copg1Q9QZE5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Copg1Q9QZE5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Copg1Q9QZE5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Copg1Q9QZE5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Copg1Q9QZE5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Copg1Q9QZE5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Copg1Q9QZE5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Copg1Q9QZE5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Copg1Q9QZE5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Copg1Q9QZE5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Copg1Q9QZE5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Copg1Q9QZE5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Copg1Q9QZE5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Copg1Q9QZE5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Copg1Q9QZE5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Copg1Q9QZE5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Copg1Q9QZE5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Copg1Q9QZE5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Copg1Q9QZE5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Copg1Q9QZE5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Copg1Q9QZE5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Copg1Q9QZE5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Copg1Q9QZE5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Copg1Q9QZE5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Copg1Q9QZE5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Copg1Q9QZE5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Copg1Q9QZE5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Copg1Q9QZE5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Copg1Q9QZE5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Copg1Q9QZE5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Copg1Q9QZE5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Copg1Q9QZE5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Copg1Q9QZE5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Copg1Q9QZE5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Copg1Q9QZE5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copg1Q9QZE5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Copg1Q9QZE5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Copg1Q9QZE5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Copg1Q9QZE5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Copg1Q9QZE5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copg1Q9QZE5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Copg1Q9QZE5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Copg1Q9QZE5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Copg1Q9QZE5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Copg1Q9QZE5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Copg1Q9QZE5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Copg1Q9QZE5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Copg1Q9QZE5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Copg1Q9QZE5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Copg1Q9QZE5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Copg1Q9QZE5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Copg1Q9QZE5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Copg1Q9QZE5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Copg1Q9QZE5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Copg1Q9QZE5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Copg1Q9QZE5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Copg1Q9QZE5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Copg1Q9QZE5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Copg1Q9QZE5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Copg1Q9QZE5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Copg1Q9QZE5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Copg1Q9QZE5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Copg1Q9QZE5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Copg1Q9QZE5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Copg1Q9QZE5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Copg1Q9QZE5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Copg1Q9QZE5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copg1Q9QZE5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copg1Q9QZE5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Copg1Q9QZE5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Copg1Q9QZE5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Copg1Q9QZE5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Copg1Q9QZE5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copg1Q9QZE5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms