Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clec4aQ9QZ15 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clec4aQ9QZ15 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clec4aQ9QZ15 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clec4aQ9QZ15 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clec4aQ9QZ15 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clec4aQ9QZ15 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Clec4aQ9QZ15 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clec4aQ9QZ15 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clec4aQ9QZ15 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clec4aQ9QZ15 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clec4aQ9QZ15 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clec4aQ9QZ15 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clec4aQ9QZ15 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clec4aQ9QZ15 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Clec4aQ9QZ15 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clec4aQ9QZ15 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clec4aQ9QZ15 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clec4aQ9QZ15 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clec4aQ9QZ15 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clec4aQ9QZ15 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clec4aQ9QZ15 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clec4aQ9QZ15 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clec4aQ9QZ15 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clec4aQ9QZ15 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clec4aQ9QZ15 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clec4aQ9QZ15 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clec4aQ9QZ15 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clec4aQ9QZ15 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clec4aQ9QZ15 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Clec4aQ9QZ15 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clec4aQ9QZ15 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clec4aQ9QZ15 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Clec4aQ9QZ15 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clec4aQ9QZ15 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clec4aQ9QZ15 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Clec4aQ9QZ15 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clec4aQ9QZ15 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clec4aQ9QZ15 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clec4aQ9QZ15 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clec4aQ9QZ15 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clec4aQ9QZ15 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Clec4aQ9QZ15 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clec4aQ9QZ15 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clec4aQ9QZ15 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clec4aQ9QZ15 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clec4aQ9QZ15 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clec4aQ9QZ15 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clec4aQ9QZ15 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Clec4aQ9QZ15 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clec4aQ9QZ15 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clec4aQ9QZ15 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clec4aQ9QZ15 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clec4aQ9QZ15 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clec4aQ9QZ15 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clec4aQ9QZ15 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clec4aQ9QZ15 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clec4aQ9QZ15 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clec4aQ9QZ15 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clec4aQ9QZ15 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clec4aQ9QZ15 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clec4aQ9QZ15 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clec4aQ9QZ15 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clec4aQ9QZ15 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clec4aQ9QZ15 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clec4aQ9QZ15 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clec4aQ9QZ15 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clec4aQ9QZ15 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clec4aQ9QZ15 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clec4aQ9QZ15 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clec4aQ9QZ15 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clec4aQ9QZ15 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Clec4aQ9QZ15 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clec4aQ9QZ15 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clec4aQ9QZ15 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clec4aQ9QZ15 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clec4aQ9QZ15 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clec4aQ9QZ15 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clec4aQ9QZ15 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clec4aQ9QZ15 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clec4aQ9QZ15 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clec4aQ9QZ15 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Clec4aQ9QZ15 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clec4aQ9QZ15 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clec4aQ9QZ15 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clec4aQ9QZ15 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clec4aQ9QZ15 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clec4aQ9QZ15 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clec4aQ9QZ15 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clec4aQ9QZ15 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clec4aQ9QZ15 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clec4aQ9QZ15 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clec4aQ9QZ15 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clec4aQ9QZ15 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clec4aQ9QZ15 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clec4aQ9QZ15 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clec4aQ9QZ15 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clec4aQ9QZ15 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clec4aQ9QZ15 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clec4aQ9QZ15 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms