Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx4Q9QY61 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Irx4Q9QY61 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Irx4Q9QY61 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Irx4Q9QY61 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Irx4Q9QY61 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Irx4Q9QY61 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Irx4Q9QY61 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Irx4Q9QY61 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Irx4Q9QY61 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Irx4Q9QY61 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Irx4Q9QY61 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Irx4Q9QY61 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Irx4Q9QY61 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irx4Q9QY61 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irx4Q9QY61 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irx4Q9QY61 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Irx4Q9QY61 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Irx4Q9QY61 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Irx4Q9QY61 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Irx4Q9QY61 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Irx4Q9QY61 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx4Q9QY61 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irx4Q9QY61 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Irx4Q9QY61 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Irx4Q9QY61 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irx4Q9QY61 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Irx4Q9QY61 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx4Q9QY61 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx4Q9QY61 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx4Q9QY61 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx4Q9QY61 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irx4Q9QY61 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx4Q9QY61 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Irx4Q9QY61 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irx4Q9QY61 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Irx4Q9QY61 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Irx4Q9QY61 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx4Q9QY61 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx4Q9QY61 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx4Q9QY61 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irx4Q9QY61 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irx4Q9QY61 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irx4Q9QY61 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irx4Q9QY61 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx4Q9QY61 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Irx4Q9QY61 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx4Q9QY61 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Irx4Q9QY61 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Irx4Q9QY61 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Irx4Q9QY61 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Irx4Q9QY61 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Irx4Q9QY61 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Irx4Q9QY61 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Irx4Q9QY61 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx4Q9QY61 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx4Q9QY61 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx4Q9QY61 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx4Q9QY61 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Irx4Q9QY61 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Irx4Q9QY61 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx4Q9QY61 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irx4Q9QY61 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irx4Q9QY61 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Irx4Q9QY61 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx4Q9QY61 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx4Q9QY61 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx4Q9QY61 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx4Q9QY61 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx4Q9QY61 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx4Q9QY61 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx4Q9QY61 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx4Q9QY61 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx4Q9QY61 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx4Q9QY61 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Irx4Q9QY61 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Irx4Q9QY61 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irx4Q9QY61 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irx4Q9QY61 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx4Q9QY61 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx4Q9QY61 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx4Q9QY61 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Irx4Q9QY61 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irx4Q9QY61 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irx4Q9QY61 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irx4Q9QY61 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx4Q9QY61 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx4Q9QY61 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx4Q9QY61 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Irx4Q9QY61 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx4Q9QY61 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms