Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY06

Myo9b, Unconventional myosin-IXb, mousemouse

Predictions only

Length 2,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo9bQ9QY06 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo9bQ9QY06 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo9bQ9QY06 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myo9bQ9QY06 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myo9bQ9QY06 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myo9bQ9QY06 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo9bQ9QY06 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo9bQ9QY06 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo9bQ9QY06 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Myo9bQ9QY06 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo9bQ9QY06 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo9bQ9QY06 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo9bQ9QY06 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo9bQ9QY06 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo9bQ9QY06 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo9bQ9QY06 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo9bQ9QY06 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo9bQ9QY06 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo9bQ9QY06 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myo9bQ9QY06 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myo9bQ9QY06 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myo9bQ9QY06 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myo9bQ9QY06 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myo9bQ9QY06 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo9bQ9QY06 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo9bQ9QY06 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo9bQ9QY06 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo9bQ9QY06 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Myo9bQ9QY06 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myo9bQ9QY06 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myo9bQ9QY06 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo9bQ9QY06 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo9bQ9QY06 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo9bQ9QY06 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo9bQ9QY06 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo9bQ9QY06 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo9bQ9QY06 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo9bQ9QY06 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo9bQ9QY06 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo9bQ9QY06 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo9bQ9QY06 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo9bQ9QY06 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo9bQ9QY06 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo9bQ9QY06 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo9bQ9QY06 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo9bQ9QY06 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo9bQ9QY06 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo9bQ9QY06 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo9bQ9QY06 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo9bQ9QY06 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo9bQ9QY06 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo9bQ9QY06 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo9bQ9QY06 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo9bQ9QY06 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo9bQ9QY06 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo9bQ9QY06 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo9bQ9QY06 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Myo9bQ9QY06 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo9bQ9QY06 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo9bQ9QY06 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo9bQ9QY06 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo9bQ9QY06 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo9bQ9QY06 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo9bQ9QY06 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo9bQ9QY06 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo9bQ9QY06 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo9bQ9QY06 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo9bQ9QY06 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo9bQ9QY06 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo9bQ9QY06 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo9bQ9QY06 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo9bQ9QY06 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo9bQ9QY06 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo9bQ9QY06 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo9bQ9QY06 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo9bQ9QY06 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo9bQ9QY06 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo9bQ9QY06 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo9bQ9QY06 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo9bQ9QY06 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo9bQ9QY06 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo9bQ9QY06 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo9bQ9QY06 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo9bQ9QY06 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo9bQ9QY06 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo9bQ9QY06 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo9bQ9QY06 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo9bQ9QY06 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo9bQ9QY06 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo9bQ9QY06 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo9bQ9QY06 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms