Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clca3a1Q9QX15 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clca3a1Q9QX15 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clca3a1Q9QX15 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clca3a1Q9QX15 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clca3a1Q9QX15 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clca3a1Q9QX15 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clca3a1Q9QX15 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clca3a1Q9QX15 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clca3a1Q9QX15 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clca3a1Q9QX15 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clca3a1Q9QX15 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clca3a1Q9QX15 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clca3a1Q9QX15 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clca3a1Q9QX15 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clca3a1Q9QX15 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clca3a1Q9QX15 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clca3a1Q9QX15 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clca3a1Q9QX15 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clca3a1Q9QX15 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clca3a1Q9QX15 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clca3a1Q9QX15 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clca3a1Q9QX15 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clca3a1Q9QX15 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clca3a1Q9QX15 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clca3a1Q9QX15 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clca3a1Q9QX15 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clca3a1Q9QX15 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clca3a1Q9QX15 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clca3a1Q9QX15 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clca3a1Q9QX15 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clca3a1Q9QX15 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clca3a1Q9QX15 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clca3a1Q9QX15 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clca3a1Q9QX15 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clca3a1Q9QX15 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clca3a1Q9QX15 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clca3a1Q9QX15 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clca3a1Q9QX15 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clca3a1Q9QX15 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clca3a1Q9QX15 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clca3a1Q9QX15 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clca3a1Q9QX15 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca3a1Q9QX15 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca3a1Q9QX15 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca3a1Q9QX15 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca3a1Q9QX15 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clca3a1Q9QX15 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clca3a1Q9QX15 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clca3a1Q9QX15 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clca3a1Q9QX15 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clca3a1Q9QX15 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clca3a1Q9QX15 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clca3a1Q9QX15 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clca3a1Q9QX15 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clca3a1Q9QX15 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clca3a1Q9QX15 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clca3a1Q9QX15 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clca3a1Q9QX15 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clca3a1Q9QX15 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clca3a1Q9QX15 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clca3a1Q9QX15 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clca3a1Q9QX15 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clca3a1Q9QX15 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clca3a1Q9QX15 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clca3a1Q9QX15 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca3a1Q9QX15 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca3a1Q9QX15 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3a1Q9QX15 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3a1Q9QX15 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3a1Q9QX15 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3a1Q9QX15 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca3a1Q9QX15 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca3a1Q9QX15 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca3a1Q9QX15 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca3a1Q9QX15 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca3a1Q9QX15 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca3a1Q9QX15 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca3a1Q9QX15 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca3a1Q9QX15 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca3a1Q9QX15 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clca3a1Q9QX15 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca3a1Q9QX15 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3a1Q9QX15 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca3a1Q9QX15 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca3a1Q9QX15 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca3a1Q9QX15 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca3a1Q9QX15 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca3a1Q9QX15 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca3a1Q9QX15 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca3a1Q9QX15 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca3a1Q9QX15 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clca3a1Q9QX15 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clca3a1Q9QX15 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clca3a1Q9QX15 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clca3a1Q9QX15 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clca3a1Q9QX15 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clca3a1Q9QX15 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms