Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gkap1Q9JMB0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gkap1Q9JMB0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gkap1Q9JMB0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gkap1Q9JMB0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gkap1Q9JMB0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gkap1Q9JMB0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gkap1Q9JMB0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gkap1Q9JMB0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gkap1Q9JMB0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gkap1Q9JMB0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gkap1Q9JMB0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gkap1Q9JMB0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gkap1Q9JMB0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gkap1Q9JMB0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gkap1Q9JMB0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gkap1Q9JMB0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gkap1Q9JMB0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gkap1Q9JMB0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gkap1Q9JMB0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gkap1Q9JMB0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gkap1Q9JMB0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gkap1Q9JMB0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gkap1Q9JMB0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gkap1Q9JMB0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gkap1Q9JMB0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gkap1Q9JMB0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gkap1Q9JMB0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gkap1Q9JMB0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gkap1Q9JMB0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gkap1Q9JMB0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gkap1Q9JMB0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gkap1Q9JMB0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gkap1Q9JMB0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gkap1Q9JMB0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gkap1Q9JMB0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gkap1Q9JMB0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gkap1Q9JMB0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gkap1Q9JMB0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gkap1Q9JMB0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gkap1Q9JMB0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gkap1Q9JMB0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gkap1Q9JMB0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gkap1Q9JMB0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gkap1Q9JMB0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gkap1Q9JMB0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gkap1Q9JMB0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gkap1Q9JMB0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gkap1Q9JMB0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gkap1Q9JMB0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gkap1Q9JMB0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gkap1Q9JMB0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gkap1Q9JMB0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gkap1Q9JMB0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gkap1Q9JMB0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gkap1Q9JMB0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gkap1Q9JMB0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gkap1Q9JMB0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gkap1Q9JMB0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gkap1Q9JMB0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gkap1Q9JMB0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gkap1Q9JMB0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gkap1Q9JMB0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gkap1Q9JMB0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gkap1Q9JMB0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gkap1Q9JMB0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gkap1Q9JMB0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gkap1Q9JMB0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gkap1Q9JMB0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gkap1Q9JMB0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gkap1Q9JMB0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gkap1Q9JMB0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gkap1Q9JMB0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gkap1Q9JMB0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gkap1Q9JMB0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gkap1Q9JMB0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gkap1Q9JMB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gkap1Q9JMB0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gkap1Q9JMB0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gkap1Q9JMB0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gkap1Q9JMB0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gkap1Q9JMB0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gkap1Q9JMB0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gkap1Q9JMB0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gkap1Q9JMB0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gkap1Q9JMB0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gkap1Q9JMB0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gkap1Q9JMB0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gkap1Q9JMB0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gkap1Q9JMB0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gkap1Q9JMB0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gkap1Q9JMB0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gkap1Q9JMB0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gkap1Q9JMB0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gkap1Q9JMB0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gkap1Q9JMB0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gkap1Q9JMB0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gkap1Q9JMB0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms