Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calm4Q9JM83 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calm4Q9JM83 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calm4Q9JM83 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calm4Q9JM83 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calm4Q9JM83 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Calm4Q9JM83 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calm4Q9JM83 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calm4Q9JM83 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calm4Q9JM83 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calm4Q9JM83 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calm4Q9JM83 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calm4Q9JM83 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calm4Q9JM83 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calm4Q9JM83 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calm4Q9JM83 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calm4Q9JM83 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calm4Q9JM83 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calm4Q9JM83 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calm4Q9JM83 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calm4Q9JM83 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calm4Q9JM83 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calm4Q9JM83 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calm4Q9JM83 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calm4Q9JM83 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calm4Q9JM83 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calm4Q9JM83 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Calm4Q9JM83 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calm4Q9JM83 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calm4Q9JM83 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calm4Q9JM83 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calm4Q9JM83 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calm4Q9JM83 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calm4Q9JM83 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Calm4Q9JM83 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calm4Q9JM83 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calm4Q9JM83 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calm4Q9JM83 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calm4Q9JM83 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm4Q9JM83 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm4Q9JM83 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calm4Q9JM83 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calm4Q9JM83 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calm4Q9JM83 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calm4Q9JM83 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm4Q9JM83 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calm4Q9JM83 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calm4Q9JM83 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calm4Q9JM83 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calm4Q9JM83 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calm4Q9JM83 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Calm4Q9JM83 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calm4Q9JM83 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Calm4Q9JM83 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calm4Q9JM83 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Calm4Q9JM83 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calm4Q9JM83 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calm4Q9JM83 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calm4Q9JM83 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calm4Q9JM83 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calm4Q9JM83 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calm4Q9JM83 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calm4Q9JM83 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calm4Q9JM83 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calm4Q9JM83 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calm4Q9JM83 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calm4Q9JM83 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calm4Q9JM83 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calm4Q9JM83 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calm4Q9JM83 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calm4Q9JM83 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calm4Q9JM83 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calm4Q9JM83 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calm4Q9JM83 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calm4Q9JM83 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calm4Q9JM83 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calm4Q9JM83 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calm4Q9JM83 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calm4Q9JM83 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calm4Q9JM83 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calm4Q9JM83 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms