Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Htr3bQ9JHJ5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Htr3bQ9JHJ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Htr3bQ9JHJ5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Htr3bQ9JHJ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Htr3bQ9JHJ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Htr3bQ9JHJ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Htr3bQ9JHJ5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Htr3bQ9JHJ5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Htr3bQ9JHJ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Htr3bQ9JHJ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Htr3bQ9JHJ5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Htr3bQ9JHJ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Htr3bQ9JHJ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Htr3bQ9JHJ5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Htr3bQ9JHJ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Htr3bQ9JHJ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Htr3bQ9JHJ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Htr3bQ9JHJ5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Htr3bQ9JHJ5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Htr3bQ9JHJ5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Htr3bQ9JHJ5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Htr3bQ9JHJ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Htr3bQ9JHJ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Htr3bQ9JHJ5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Htr3bQ9JHJ5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Htr3bQ9JHJ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Htr3bQ9JHJ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Htr3bQ9JHJ5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Htr3bQ9JHJ5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Htr3bQ9JHJ5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Htr3bQ9JHJ5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Htr3bQ9JHJ5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Htr3bQ9JHJ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Htr3bQ9JHJ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Htr3bQ9JHJ5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Htr3bQ9JHJ5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Htr3bQ9JHJ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Htr3bQ9JHJ5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Htr3bQ9JHJ5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Htr3bQ9JHJ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Htr3bQ9JHJ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Htr3bQ9JHJ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Htr3bQ9JHJ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Htr3bQ9JHJ5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Htr3bQ9JHJ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Htr3bQ9JHJ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Htr3bQ9JHJ5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Htr3bQ9JHJ5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Htr3bQ9JHJ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Htr3bQ9JHJ5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Htr3bQ9JHJ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Htr3bQ9JHJ5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Htr3bQ9JHJ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Htr3bQ9JHJ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Htr3bQ9JHJ5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Htr3bQ9JHJ5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Htr3bQ9JHJ5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Htr3bQ9JHJ5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Htr3bQ9JHJ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Htr3bQ9JHJ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Htr3bQ9JHJ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Htr3bQ9JHJ5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htr3bQ9JHJ5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Htr3bQ9JHJ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Htr3bQ9JHJ5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Htr3bQ9JHJ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Htr3bQ9JHJ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Htr3bQ9JHJ5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Htr3bQ9JHJ5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Htr3bQ9JHJ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htr3bQ9JHJ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Htr3bQ9JHJ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Htr3bQ9JHJ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Htr3bQ9JHJ5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Htr3bQ9JHJ5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Htr3bQ9JHJ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Htr3bQ9JHJ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Htr3bQ9JHJ5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Htr3bQ9JHJ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Htr3bQ9JHJ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Htr3bQ9JHJ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Htr3bQ9JHJ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Htr3bQ9JHJ5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Htr3bQ9JHJ5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Htr3bQ9JHJ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Htr3bQ9JHJ5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms