Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a4bQ9ES61 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a4bQ9ES61 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a4bQ9ES61 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a4bQ9ES61 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a4bQ9ES61 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a4bQ9ES61 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a4bQ9ES61 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a4bQ9ES61 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a4bQ9ES61 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a4bQ9ES61 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a4bQ9ES61 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a4bQ9ES61 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a4bQ9ES61 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a4bQ9ES61 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a4bQ9ES61 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a4bQ9ES61 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a4bQ9ES61 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a4bQ9ES61 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a4bQ9ES61 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a4bQ9ES61 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a4bQ9ES61 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a4bQ9ES61 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a4bQ9ES61 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a4bQ9ES61 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a4bQ9ES61 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a4bQ9ES61 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a4bQ9ES61 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a4bQ9ES61 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a4bQ9ES61 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a4bQ9ES61 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a4bQ9ES61 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a4bQ9ES61 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a4bQ9ES61 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a4bQ9ES61 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a4bQ9ES61 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a4bQ9ES61 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a4bQ9ES61 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a4bQ9ES61 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a4bQ9ES61 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a4bQ9ES61 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a4bQ9ES61 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a4bQ9ES61 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a4bQ9ES61 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a4bQ9ES61 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a4bQ9ES61 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a4bQ9ES61 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a4bQ9ES61 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a4bQ9ES61 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a4bQ9ES61 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a4bQ9ES61 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a4bQ9ES61 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a4bQ9ES61 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a4bQ9ES61 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a4bQ9ES61 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a4bQ9ES61 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a4bQ9ES61 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a4bQ9ES61 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a4bQ9ES61 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a4bQ9ES61 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a4bQ9ES61 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a4bQ9ES61 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a4bQ9ES61 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a4bQ9ES61 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a4bQ9ES61 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a4bQ9ES61 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a4bQ9ES61 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a4bQ9ES61 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a4bQ9ES61 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a4bQ9ES61 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a4bQ9ES61 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a4bQ9ES61 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a4bQ9ES61 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a4bQ9ES61 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a4bQ9ES61 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a4bQ9ES61 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a4bQ9ES61 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a4bQ9ES61 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a4bQ9ES61 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a4bQ9ES61 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a4bQ9ES61 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ms4a4bQ9ES61 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ms4a4bQ9ES61 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ms4a4bQ9ES61 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ms4a4bQ9ES61 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ms4a4bQ9ES61 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a4bQ9ES61 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a4bQ9ES61 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms