Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stx12Q9ER00 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stx12Q9ER00 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stx12Q9ER00 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx12Q9ER00 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stx12Q9ER00 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stx12Q9ER00 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stx12Q9ER00 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx12Q9ER00 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx12Q9ER00 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx12Q9ER00 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stx12Q9ER00 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx12Q9ER00 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stx12Q9ER00 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx12Q9ER00 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx12Q9ER00 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx12Q9ER00 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx12Q9ER00 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx12Q9ER00 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx12Q9ER00 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stx12Q9ER00 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx12Q9ER00 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx12Q9ER00 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx12Q9ER00 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Stx12Q9ER00 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx12Q9ER00 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx12Q9ER00 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx12Q9ER00 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx12Q9ER00 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx12Q9ER00 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx12Q9ER00 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx12Q9ER00 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx12Q9ER00 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Stx12Q9ER00 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Stx12Q9ER00 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx12Q9ER00 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx12Q9ER00 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx12Q9ER00 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx12Q9ER00 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx12Q9ER00 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx12Q9ER00 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx12Q9ER00 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx12Q9ER00 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx12Q9ER00 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx12Q9ER00 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx12Q9ER00 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx12Q9ER00 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx12Q9ER00 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx12Q9ER00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx12Q9ER00 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx12Q9ER00 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx12Q9ER00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx12Q9ER00 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx12Q9ER00 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx12Q9ER00 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx12Q9ER00 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx12Q9ER00 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx12Q9ER00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx12Q9ER00 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx12Q9ER00 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx12Q9ER00 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx12Q9ER00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx12Q9ER00 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx12Q9ER00 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx12Q9ER00 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx12Q9ER00 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx12Q9ER00 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx12Q9ER00 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx12Q9ER00 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx12Q9ER00 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx12Q9ER00 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx12Q9ER00 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx12Q9ER00 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx12Q9ER00 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx12Q9ER00 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx12Q9ER00 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx12Q9ER00 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx12Q9ER00 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx12Q9ER00 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx12Q9ER00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx12Q9ER00 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms