Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arfgap1Q9EPJ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfgap1Q9EPJ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arfgap1Q9EPJ9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arfgap1Q9EPJ9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfgap1Q9EPJ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgap1Q9EPJ9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfgap1Q9EPJ9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Arfgap1Q9EPJ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgap1Q9EPJ9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgap1Q9EPJ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfgap1Q9EPJ9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgap1Q9EPJ9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfgap1Q9EPJ9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgap1Q9EPJ9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgap1Q9EPJ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgap1Q9EPJ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgap1Q9EPJ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arfgap1Q9EPJ9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfgap1Q9EPJ9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfgap1Q9EPJ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfgap1Q9EPJ9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfgap1Q9EPJ9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfgap1Q9EPJ9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arfgap1Q9EPJ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arfgap1Q9EPJ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arfgap1Q9EPJ9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arfgap1Q9EPJ9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfgap1Q9EPJ9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfgap1Q9EPJ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfgap1Q9EPJ9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfgap1Q9EPJ9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arfgap1Q9EPJ9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arfgap1Q9EPJ9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfgap1Q9EPJ9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfgap1Q9EPJ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgap1Q9EPJ9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arfgap1Q9EPJ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfgap1Q9EPJ9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfgap1Q9EPJ9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfgap1Q9EPJ9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgap1Q9EPJ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgap1Q9EPJ9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfgap1Q9EPJ9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfgap1Q9EPJ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfgap1Q9EPJ9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfgap1Q9EPJ9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Arfgap1Q9EPJ9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfgap1Q9EPJ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfgap1Q9EPJ9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfgap1Q9EPJ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfgap1Q9EPJ9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfgap1Q9EPJ9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfgap1Q9EPJ9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfgap1Q9EPJ9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfgap1Q9EPJ9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arfgap1Q9EPJ9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arfgap1Q9EPJ9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfgap1Q9EPJ9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfgap1Q9EPJ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgap1Q9EPJ9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgap1Q9EPJ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgap1Q9EPJ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfgap1Q9EPJ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgap1Q9EPJ9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgap1Q9EPJ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgap1Q9EPJ9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgap1Q9EPJ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgap1Q9EPJ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgap1Q9EPJ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfgap1Q9EPJ9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfgap1Q9EPJ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfgap1Q9EPJ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfgap1Q9EPJ9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arfgap1Q9EPJ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgap1Q9EPJ9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgap1Q9EPJ9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgap1Q9EPJ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgap1Q9EPJ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgap1Q9EPJ9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgap1Q9EPJ9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfgap1Q9EPJ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgap1Q9EPJ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgap1Q9EPJ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms