Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU9

Hoga1, 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoga1Q9DCU9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoga1Q9DCU9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoga1Q9DCU9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoga1Q9DCU9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoga1Q9DCU9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoga1Q9DCU9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoga1Q9DCU9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoga1Q9DCU9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoga1Q9DCU9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoga1Q9DCU9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoga1Q9DCU9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoga1Q9DCU9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoga1Q9DCU9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoga1Q9DCU9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoga1Q9DCU9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoga1Q9DCU9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoga1Q9DCU9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoga1Q9DCU9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoga1Q9DCU9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoga1Q9DCU9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoga1Q9DCU9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoga1Q9DCU9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoga1Q9DCU9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoga1Q9DCU9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoga1Q9DCU9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoga1Q9DCU9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoga1Q9DCU9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoga1Q9DCU9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoga1Q9DCU9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoga1Q9DCU9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoga1Q9DCU9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoga1Q9DCU9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoga1Q9DCU9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoga1Q9DCU9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoga1Q9DCU9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoga1Q9DCU9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoga1Q9DCU9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoga1Q9DCU9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoga1Q9DCU9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoga1Q9DCU9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoga1Q9DCU9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoga1Q9DCU9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoga1Q9DCU9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoga1Q9DCU9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoga1Q9DCU9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoga1Q9DCU9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoga1Q9DCU9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoga1Q9DCU9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoga1Q9DCU9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoga1Q9DCU9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoga1Q9DCU9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoga1Q9DCU9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoga1Q9DCU9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoga1Q9DCU9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoga1Q9DCU9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoga1Q9DCU9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoga1Q9DCU9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoga1Q9DCU9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoga1Q9DCU9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoga1Q9DCU9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoga1Q9DCU9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoga1Q9DCU9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoga1Q9DCU9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoga1Q9DCU9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoga1Q9DCU9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoga1Q9DCU9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoga1Q9DCU9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoga1Q9DCU9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoga1Q9DCU9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoga1Q9DCU9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoga1Q9DCU9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoga1Q9DCU9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoga1Q9DCU9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoga1Q9DCU9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoga1Q9DCU9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoga1Q9DCU9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoga1Q9DCU9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoga1Q9DCU9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoga1Q9DCU9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoga1Q9DCU9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoga1Q9DCU9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoga1Q9DCU9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoga1Q9DCU9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoga1Q9DCU9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoga1Q9DCU9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoga1Q9DCU9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoga1Q9DCU9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoga1Q9DCU9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoga1Q9DCU9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoga1Q9DCU9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoga1Q9DCU9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms