Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmgn3Q9DCB1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmgn3Q9DCB1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn3Q9DCB1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmgn3Q9DCB1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgn3Q9DCB1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgn3Q9DCB1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmgn3Q9DCB1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmgn3Q9DCB1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmgn3Q9DCB1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmgn3Q9DCB1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmgn3Q9DCB1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn3Q9DCB1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgn3Q9DCB1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgn3Q9DCB1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgn3Q9DCB1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmgn3Q9DCB1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmgn3Q9DCB1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgn3Q9DCB1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgn3Q9DCB1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgn3Q9DCB1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmgn3Q9DCB1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmgn3Q9DCB1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmgn3Q9DCB1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmgn3Q9DCB1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgn3Q9DCB1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgn3Q9DCB1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgn3Q9DCB1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgn3Q9DCB1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgn3Q9DCB1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgn3Q9DCB1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgn3Q9DCB1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgn3Q9DCB1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmgn3Q9DCB1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmgn3Q9DCB1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmgn3Q9DCB1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmgn3Q9DCB1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgn3Q9DCB1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgn3Q9DCB1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgn3Q9DCB1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmgn3Q9DCB1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgn3Q9DCB1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgn3Q9DCB1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgn3Q9DCB1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgn3Q9DCB1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgn3Q9DCB1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgn3Q9DCB1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgn3Q9DCB1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgn3Q9DCB1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgn3Q9DCB1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgn3Q9DCB1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgn3Q9DCB1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgn3Q9DCB1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn3Q9DCB1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn3Q9DCB1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgn3Q9DCB1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgn3Q9DCB1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgn3Q9DCB1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgn3Q9DCB1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgn3Q9DCB1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmgn3Q9DCB1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgn3Q9DCB1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgn3Q9DCB1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmgn3Q9DCB1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgn3Q9DCB1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgn3Q9DCB1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgn3Q9DCB1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgn3Q9DCB1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgn3Q9DCB1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgn3Q9DCB1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmgn3Q9DCB1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgn3Q9DCB1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgn3Q9DCB1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgn3Q9DCB1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgn3Q9DCB1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn3Q9DCB1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn3Q9DCB1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn3Q9DCB1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgn3Q9DCB1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgn3Q9DCB1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmgn3Q9DCB1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgn3Q9DCB1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgn3Q9DCB1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmgn3Q9DCB1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmgn3Q9DCB1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgn3Q9DCB1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmgn3Q9DCB1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn3Q9DCB1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn3Q9DCB1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgn3Q9DCB1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgn3Q9DCB1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmgn3Q9DCB1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmgn3Q9DCB1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmgn3Q9DCB1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1043.5 ms