Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB75

Cdip1, Cell death-inducing p53-target protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdip1Q9DB75 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdip1Q9DB75 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdip1Q9DB75 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdip1Q9DB75 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdip1Q9DB75 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdip1Q9DB75 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdip1Q9DB75 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdip1Q9DB75 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdip1Q9DB75 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdip1Q9DB75 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdip1Q9DB75 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdip1Q9DB75 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdip1Q9DB75 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdip1Q9DB75 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdip1Q9DB75 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdip1Q9DB75 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdip1Q9DB75 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdip1Q9DB75 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdip1Q9DB75 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdip1Q9DB75 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdip1Q9DB75 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdip1Q9DB75 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdip1Q9DB75 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdip1Q9DB75 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdip1Q9DB75 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdip1Q9DB75 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdip1Q9DB75 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdip1Q9DB75 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdip1Q9DB75 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdip1Q9DB75 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdip1Q9DB75 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdip1Q9DB75 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdip1Q9DB75 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdip1Q9DB75 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdip1Q9DB75 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdip1Q9DB75 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdip1Q9DB75 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdip1Q9DB75 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdip1Q9DB75 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdip1Q9DB75 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdip1Q9DB75 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdip1Q9DB75 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdip1Q9DB75 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdip1Q9DB75 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdip1Q9DB75 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdip1Q9DB75 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdip1Q9DB75 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdip1Q9DB75 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdip1Q9DB75 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdip1Q9DB75 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdip1Q9DB75 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdip1Q9DB75 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdip1Q9DB75 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdip1Q9DB75 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdip1Q9DB75 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdip1Q9DB75 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdip1Q9DB75 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdip1Q9DB75 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdip1Q9DB75 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdip1Q9DB75 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdip1Q9DB75 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdip1Q9DB75 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdip1Q9DB75 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdip1Q9DB75 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdip1Q9DB75 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms