Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700012A03RikQ9DAF1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700012A03RikQ9DAF1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700012A03RikQ9DAF1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700012A03RikQ9DAF1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700012A03RikQ9DAF1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700012A03RikQ9DAF1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700012A03RikQ9DAF1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700012A03RikQ9DAF1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700012A03RikQ9DAF1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700012A03RikQ9DAF1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700012A03RikQ9DAF1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700012A03RikQ9DAF1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700012A03RikQ9DAF1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700012A03RikQ9DAF1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700012A03RikQ9DAF1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700012A03RikQ9DAF1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700012A03RikQ9DAF1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700012A03RikQ9DAF1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700012A03RikQ9DAF1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
1700012A03RikQ9DAF1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700012A03RikQ9DAF1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700012A03RikQ9DAF1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700012A03RikQ9DAF1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700012A03RikQ9DAF1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700012A03RikQ9DAF1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700012A03RikQ9DAF1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700012A03RikQ9DAF1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700012A03RikQ9DAF1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
1700012A03RikQ9DAF1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700012A03RikQ9DAF1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700012A03RikQ9DAF1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700012A03RikQ9DAF1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700012A03RikQ9DAF1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700012A03RikQ9DAF1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700012A03RikQ9DAF1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700012A03RikQ9DAF1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700012A03RikQ9DAF1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700012A03RikQ9DAF1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700012A03RikQ9DAF1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700012A03RikQ9DAF1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700012A03RikQ9DAF1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700012A03RikQ9DAF1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700012A03RikQ9DAF1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700012A03RikQ9DAF1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700012A03RikQ9DAF1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700012A03RikQ9DAF1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700012A03RikQ9DAF1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700012A03RikQ9DAF1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
1700012A03RikQ9DAF1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700012A03RikQ9DAF1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700012A03RikQ9DAF1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700012A03RikQ9DAF1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700012A03RikQ9DAF1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700012A03RikQ9DAF1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
1700012A03RikQ9DAF1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700012A03RikQ9DAF1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700012A03RikQ9DAF1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700012A03RikQ9DAF1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700012A03RikQ9DAF1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700012A03RikQ9DAF1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700012A03RikQ9DAF1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700012A03RikQ9DAF1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700012A03RikQ9DAF1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700012A03RikQ9DAF1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700012A03RikQ9DAF1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700012A03RikQ9DAF1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700012A03RikQ9DAF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700012A03RikQ9DAF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700012A03RikQ9DAF1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700012A03RikQ9DAF1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700012A03RikQ9DAF1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700012A03RikQ9DAF1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
1700012A03RikQ9DAF1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700012A03RikQ9DAF1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700012A03RikQ9DAF1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700012A03RikQ9DAF1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700012A03RikQ9DAF1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms