Protein–RNA interactions for Protein: Q9D976

Trp53tg5, Transformation-related protein 53 target 5, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53tg5Q9D976 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trp53tg5Q9D976 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trp53tg5Q9D976 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trp53tg5Q9D976 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trp53tg5Q9D976 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trp53tg5Q9D976 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trp53tg5Q9D976 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trp53tg5Q9D976 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trp53tg5Q9D976 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trp53tg5Q9D976 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trp53tg5Q9D976 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trp53tg5Q9D976 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trp53tg5Q9D976 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trp53tg5Q9D976 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trp53tg5Q9D976 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trp53tg5Q9D976 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trp53tg5Q9D976 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trp53tg5Q9D976 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trp53tg5Q9D976 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trp53tg5Q9D976 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trp53tg5Q9D976 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trp53tg5Q9D976 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trp53tg5Q9D976 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trp53tg5Q9D976 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trp53tg5Q9D976 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trp53tg5Q9D976 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trp53tg5Q9D976 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trp53tg5Q9D976 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trp53tg5Q9D976 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trp53tg5Q9D976 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trp53tg5Q9D976 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trp53tg5Q9D976 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trp53tg5Q9D976 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trp53tg5Q9D976 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trp53tg5Q9D976 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trp53tg5Q9D976 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trp53tg5Q9D976 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trp53tg5Q9D976 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trp53tg5Q9D976 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trp53tg5Q9D976 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trp53tg5Q9D976 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trp53tg5Q9D976 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trp53tg5Q9D976 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trp53tg5Q9D976 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53tg5Q9D976 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trp53tg5Q9D976 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53tg5Q9D976 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53tg5Q9D976 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trp53tg5Q9D976 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trp53tg5Q9D976 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trp53tg5Q9D976 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trp53tg5Q9D976 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trp53tg5Q9D976 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trp53tg5Q9D976 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trp53tg5Q9D976 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trp53tg5Q9D976 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trp53tg5Q9D976 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trp53tg5Q9D976 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trp53tg5Q9D976 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trp53tg5Q9D976 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trp53tg5Q9D976 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trp53tg5Q9D976 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trp53tg5Q9D976 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trp53tg5Q9D976 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trp53tg5Q9D976 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trp53tg5Q9D976 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trp53tg5Q9D976 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53tg5Q9D976 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53tg5Q9D976 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trp53tg5Q9D976 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trp53tg5Q9D976 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trp53tg5Q9D976 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trp53tg5Q9D976 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trp53tg5Q9D976 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trp53tg5Q9D976 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trp53tg5Q9D976 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trp53tg5Q9D976 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trp53tg5Q9D976 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trp53tg5Q9D976 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trp53tg5Q9D976 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trp53tg5Q9D976 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trp53tg5Q9D976 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trp53tg5Q9D976 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trp53tg5Q9D976 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trp53tg5Q9D976 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trp53tg5Q9D976 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trp53tg5Q9D976 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trp53tg5Q9D976 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trp53tg5Q9D976 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trp53tg5Q9D976 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53tg5Q9D976 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trp53tg5Q9D976 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trp53tg5Q9D976 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trp53tg5Q9D976 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trp53tg5Q9D976 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trp53tg5Q9D976 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trp53tg5Q9D976 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trp53tg5Q9D976 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trp53tg5Q9D976 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trp53tg5Q9D976 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms