Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem41aQ9D8U2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem41aQ9D8U2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem41aQ9D8U2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmem41aQ9D8U2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem41aQ9D8U2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem41aQ9D8U2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem41aQ9D8U2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem41aQ9D8U2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem41aQ9D8U2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmem41aQ9D8U2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem41aQ9D8U2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem41aQ9D8U2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem41aQ9D8U2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem41aQ9D8U2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem41aQ9D8U2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem41aQ9D8U2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem41aQ9D8U2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem41aQ9D8U2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem41aQ9D8U2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem41aQ9D8U2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem41aQ9D8U2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem41aQ9D8U2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem41aQ9D8U2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem41aQ9D8U2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem41aQ9D8U2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem41aQ9D8U2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem41aQ9D8U2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem41aQ9D8U2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem41aQ9D8U2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem41aQ9D8U2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem41aQ9D8U2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem41aQ9D8U2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem41aQ9D8U2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem41aQ9D8U2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem41aQ9D8U2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem41aQ9D8U2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem41aQ9D8U2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem41aQ9D8U2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem41aQ9D8U2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem41aQ9D8U2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem41aQ9D8U2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem41aQ9D8U2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem41aQ9D8U2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem41aQ9D8U2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem41aQ9D8U2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem41aQ9D8U2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem41aQ9D8U2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem41aQ9D8U2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem41aQ9D8U2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem41aQ9D8U2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem41aQ9D8U2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem41aQ9D8U2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem41aQ9D8U2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem41aQ9D8U2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem41aQ9D8U2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem41aQ9D8U2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem41aQ9D8U2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem41aQ9D8U2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem41aQ9D8U2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem41aQ9D8U2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem41aQ9D8U2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem41aQ9D8U2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem41aQ9D8U2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem41aQ9D8U2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem41aQ9D8U2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem41aQ9D8U2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem41aQ9D8U2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem41aQ9D8U2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem41aQ9D8U2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem41aQ9D8U2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem41aQ9D8U2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem41aQ9D8U2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem41aQ9D8U2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem41aQ9D8U2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem41aQ9D8U2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem41aQ9D8U2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem41aQ9D8U2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem41aQ9D8U2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem41aQ9D8U2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem41aQ9D8U2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem41aQ9D8U2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem41aQ9D8U2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem41aQ9D8U2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem41aQ9D8U2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem41aQ9D8U2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem41aQ9D8U2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem41aQ9D8U2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem41aQ9D8U2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem41aQ9D8U2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem41aQ9D8U2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem41aQ9D8U2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem41aQ9D8U2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem41aQ9D8U2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem41aQ9D8U2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem41aQ9D8U2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem41aQ9D8U2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem41aQ9D8U2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem41aQ9D8U2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem41aQ9D8U2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms