Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Timm50Q9D880 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Timm50Q9D880 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Timm50Q9D880 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Timm50Q9D880 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Timm50Q9D880 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Timm50Q9D880 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Timm50Q9D880 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Timm50Q9D880 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Timm50Q9D880 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Timm50Q9D880 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Timm50Q9D880 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Timm50Q9D880 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Timm50Q9D880 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Timm50Q9D880 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Timm50Q9D880 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Timm50Q9D880 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Timm50Q9D880 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Timm50Q9D880 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Timm50Q9D880 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Timm50Q9D880 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Timm50Q9D880 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Timm50Q9D880 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Timm50Q9D880 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Timm50Q9D880 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Timm50Q9D880 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Timm50Q9D880 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Timm50Q9D880 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Timm50Q9D880 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Timm50Q9D880 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Timm50Q9D880 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Timm50Q9D880 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Timm50Q9D880 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Timm50Q9D880 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Timm50Q9D880 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Timm50Q9D880 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm50Q9D880 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm50Q9D880 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timm50Q9D880 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timm50Q9D880 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timm50Q9D880 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Timm50Q9D880 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Timm50Q9D880 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Timm50Q9D880 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Timm50Q9D880 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Timm50Q9D880 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Timm50Q9D880 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Timm50Q9D880 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Timm50Q9D880 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Timm50Q9D880 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Timm50Q9D880 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Timm50Q9D880 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Timm50Q9D880 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Timm50Q9D880 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Timm50Q9D880 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Timm50Q9D880 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Timm50Q9D880 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Timm50Q9D880 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Timm50Q9D880 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Timm50Q9D880 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Timm50Q9D880 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Timm50Q9D880 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Timm50Q9D880 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Timm50Q9D880 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Timm50Q9D880 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Timm50Q9D880 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Timm50Q9D880 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Timm50Q9D880 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Timm50Q9D880 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Timm50Q9D880 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Timm50Q9D880 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Timm50Q9D880 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Timm50Q9D880 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Timm50Q9D880 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Timm50Q9D880 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Timm50Q9D880 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Timm50Q9D880 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Timm50Q9D880 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Timm50Q9D880 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Timm50Q9D880 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Timm50Q9D880 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm50Q9D880 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm50Q9D880 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm50Q9D880 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm50Q9D880 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Timm50Q9D880 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Timm50Q9D880 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Timm50Q9D880 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Timm50Q9D880 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Timm50Q9D880 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms