Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6V8

Paip2, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip2Q9D6V8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paip2Q9D6V8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Paip2Q9D6V8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Paip2Q9D6V8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paip2Q9D6V8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paip2Q9D6V8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Paip2Q9D6V8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paip2Q9D6V8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Paip2Q9D6V8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Paip2Q9D6V8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Paip2Q9D6V8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Paip2Q9D6V8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paip2Q9D6V8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Paip2Q9D6V8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paip2Q9D6V8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paip2Q9D6V8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Paip2Q9D6V8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paip2Q9D6V8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Paip2Q9D6V8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Paip2Q9D6V8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Paip2Q9D6V8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paip2Q9D6V8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paip2Q9D6V8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Paip2Q9D6V8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Paip2Q9D6V8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paip2Q9D6V8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Paip2Q9D6V8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Paip2Q9D6V8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Paip2Q9D6V8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Paip2Q9D6V8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Paip2Q9D6V8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paip2Q9D6V8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Paip2Q9D6V8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Paip2Q9D6V8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paip2Q9D6V8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paip2Q9D6V8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Paip2Q9D6V8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paip2Q9D6V8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paip2Q9D6V8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Paip2Q9D6V8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Paip2Q9D6V8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Paip2Q9D6V8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paip2Q9D6V8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Paip2Q9D6V8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Paip2Q9D6V8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Paip2Q9D6V8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Paip2Q9D6V8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Paip2Q9D6V8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Paip2Q9D6V8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Paip2Q9D6V8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Paip2Q9D6V8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paip2Q9D6V8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paip2Q9D6V8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Paip2Q9D6V8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paip2Q9D6V8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paip2Q9D6V8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paip2Q9D6V8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Paip2Q9D6V8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paip2Q9D6V8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paip2Q9D6V8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Paip2Q9D6V8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Paip2Q9D6V8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Paip2Q9D6V8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paip2Q9D6V8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Paip2Q9D6V8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Paip2Q9D6V8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Paip2Q9D6V8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paip2Q9D6V8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Paip2Q9D6V8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Paip2Q9D6V8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Paip2Q9D6V8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Paip2Q9D6V8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Paip2Q9D6V8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Paip2Q9D6V8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Paip2Q9D6V8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Paip2Q9D6V8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Paip2Q9D6V8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paip2Q9D6V8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paip2Q9D6V8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paip2Q9D6V8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paip2Q9D6V8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paip2Q9D6V8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paip2Q9D6V8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paip2Q9D6V8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Paip2Q9D6V8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Paip2Q9D6V8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paip2Q9D6V8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paip2Q9D6V8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paip2Q9D6V8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paip2Q9D6V8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paip2Q9D6V8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Paip2Q9D6V8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Paip2Q9D6V8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Paip2Q9D6V8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Paip2Q9D6V8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Paip2Q9D6V8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paip2Q9D6V8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Paip2Q9D6V8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paip2Q9D6V8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Paip2Q9D6V8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms