Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5G7

4930442H23Rik, MCG148091, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930442H23RikQ9D5G7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930442H23RikQ9D5G7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930442H23RikQ9D5G7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930442H23RikQ9D5G7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930442H23RikQ9D5G7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930442H23RikQ9D5G7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930442H23RikQ9D5G7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930442H23RikQ9D5G7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930442H23RikQ9D5G7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930442H23RikQ9D5G7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930442H23RikQ9D5G7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930442H23RikQ9D5G7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930442H23RikQ9D5G7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930442H23RikQ9D5G7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930442H23RikQ9D5G7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930442H23RikQ9D5G7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
4930442H23RikQ9D5G7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930442H23RikQ9D5G7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930442H23RikQ9D5G7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930442H23RikQ9D5G7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930442H23RikQ9D5G7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930442H23RikQ9D5G7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930442H23RikQ9D5G7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930442H23RikQ9D5G7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930442H23RikQ9D5G7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930442H23RikQ9D5G7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930442H23RikQ9D5G7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930442H23RikQ9D5G7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930442H23RikQ9D5G7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930442H23RikQ9D5G7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930442H23RikQ9D5G7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930442H23RikQ9D5G7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930442H23RikQ9D5G7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930442H23RikQ9D5G7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930442H23RikQ9D5G7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930442H23RikQ9D5G7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930442H23RikQ9D5G7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930442H23RikQ9D5G7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930442H23RikQ9D5G7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930442H23RikQ9D5G7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930442H23RikQ9D5G7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930442H23RikQ9D5G7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930442H23RikQ9D5G7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930442H23RikQ9D5G7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930442H23RikQ9D5G7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930442H23RikQ9D5G7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930442H23RikQ9D5G7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930442H23RikQ9D5G7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930442H23RikQ9D5G7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
4930442H23RikQ9D5G7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930442H23RikQ9D5G7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930442H23RikQ9D5G7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930442H23RikQ9D5G7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930442H23RikQ9D5G7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930442H23RikQ9D5G7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930442H23RikQ9D5G7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930442H23RikQ9D5G7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930442H23RikQ9D5G7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930442H23RikQ9D5G7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930442H23RikQ9D5G7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930442H23RikQ9D5G7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930442H23RikQ9D5G7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930442H23RikQ9D5G7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930442H23RikQ9D5G7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930442H23RikQ9D5G7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930442H23RikQ9D5G7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930442H23RikQ9D5G7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930442H23RikQ9D5G7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930442H23RikQ9D5G7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930442H23RikQ9D5G7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930442H23RikQ9D5G7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930442H23RikQ9D5G7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4930442H23RikQ9D5G7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930442H23RikQ9D5G7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930442H23RikQ9D5G7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930442H23RikQ9D5G7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930442H23RikQ9D5G7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930442H23RikQ9D5G7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930442H23RikQ9D5G7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930442H23RikQ9D5G7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930442H23RikQ9D5G7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930442H23RikQ9D5G7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms