Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
D930007J09RikQ9D2K6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
D930007J09RikQ9D2K6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
D930007J09RikQ9D2K6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
D930007J09RikQ9D2K6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D930007J09RikQ9D2K6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D930007J09RikQ9D2K6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
D930007J09RikQ9D2K6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
D930007J09RikQ9D2K6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
D930007J09RikQ9D2K6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
D930007J09RikQ9D2K6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
D930007J09RikQ9D2K6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D930007J09RikQ9D2K6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
D930007J09RikQ9D2K6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
D930007J09RikQ9D2K6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
D930007J09RikQ9D2K6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
D930007J09RikQ9D2K6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D930007J09RikQ9D2K6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D930007J09RikQ9D2K6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
D930007J09RikQ9D2K6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
D930007J09RikQ9D2K6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
D930007J09RikQ9D2K6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
D930007J09RikQ9D2K6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
D930007J09RikQ9D2K6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
D930007J09RikQ9D2K6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
D930007J09RikQ9D2K6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
D930007J09RikQ9D2K6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D930007J09RikQ9D2K6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
D930007J09RikQ9D2K6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
D930007J09RikQ9D2K6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
D930007J09RikQ9D2K6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
D930007J09RikQ9D2K6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
D930007J09RikQ9D2K6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
D930007J09RikQ9D2K6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
D930007J09RikQ9D2K6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
D930007J09RikQ9D2K6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
D930007J09RikQ9D2K6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
D930007J09RikQ9D2K6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
D930007J09RikQ9D2K6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
D930007J09RikQ9D2K6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
D930007J09RikQ9D2K6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
D930007J09RikQ9D2K6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
D930007J09RikQ9D2K6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
D930007J09RikQ9D2K6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
D930007J09RikQ9D2K6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D930007J09RikQ9D2K6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D930007J09RikQ9D2K6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D930007J09RikQ9D2K6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D930007J09RikQ9D2K6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D930007J09RikQ9D2K6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
D930007J09RikQ9D2K6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
D930007J09RikQ9D2K6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
D930007J09RikQ9D2K6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
D930007J09RikQ9D2K6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
D930007J09RikQ9D2K6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
D930007J09RikQ9D2K6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
D930007J09RikQ9D2K6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
D930007J09RikQ9D2K6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
D930007J09RikQ9D2K6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
D930007J09RikQ9D2K6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
D930007J09RikQ9D2K6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
D930007J09RikQ9D2K6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
D930007J09RikQ9D2K6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
D930007J09RikQ9D2K6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
D930007J09RikQ9D2K6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
D930007J09RikQ9D2K6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
D930007J09RikQ9D2K6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
D930007J09RikQ9D2K6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
D930007J09RikQ9D2K6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
D930007J09RikQ9D2K6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
D930007J09RikQ9D2K6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
D930007J09RikQ9D2K6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
D930007J09RikQ9D2K6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
D930007J09RikQ9D2K6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
D930007J09RikQ9D2K6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
D930007J09RikQ9D2K6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
D930007J09RikQ9D2K6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D930007J09RikQ9D2K6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
D930007J09RikQ9D2K6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D930007J09RikQ9D2K6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
D930007J09RikQ9D2K6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
D930007J09RikQ9D2K6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D930007J09RikQ9D2K6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
D930007J09RikQ9D2K6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
D930007J09RikQ9D2K6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D930007J09RikQ9D2K6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
D930007J09RikQ9D2K6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
D930007J09RikQ9D2K6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
D930007J09RikQ9D2K6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
D930007J09RikQ9D2K6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
D930007J09RikQ9D2K6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D930007J09RikQ9D2K6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms