Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fndc8Q9D2H8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc8Q9D2H8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc8Q9D2H8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc8Q9D2H8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc8Q9D2H8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc8Q9D2H8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc8Q9D2H8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc8Q9D2H8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc8Q9D2H8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc8Q9D2H8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc8Q9D2H8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc8Q9D2H8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc8Q9D2H8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc8Q9D2H8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc8Q9D2H8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc8Q9D2H8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc8Q9D2H8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc8Q9D2H8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc8Q9D2H8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc8Q9D2H8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Fndc8Q9D2H8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc8Q9D2H8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc8Q9D2H8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc8Q9D2H8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc8Q9D2H8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc8Q9D2H8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc8Q9D2H8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc8Q9D2H8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc8Q9D2H8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc8Q9D2H8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc8Q9D2H8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc8Q9D2H8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc8Q9D2H8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc8Q9D2H8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc8Q9D2H8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc8Q9D2H8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc8Q9D2H8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc8Q9D2H8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fndc8Q9D2H8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc8Q9D2H8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fndc8Q9D2H8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Fndc8Q9D2H8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc8Q9D2H8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc8Q9D2H8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc8Q9D2H8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc8Q9D2H8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc8Q9D2H8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc8Q9D2H8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc8Q9D2H8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc8Q9D2H8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc8Q9D2H8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc8Q9D2H8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc8Q9D2H8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc8Q9D2H8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc8Q9D2H8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc8Q9D2H8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc8Q9D2H8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc8Q9D2H8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc8Q9D2H8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc8Q9D2H8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc8Q9D2H8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fndc8Q9D2H8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc8Q9D2H8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc8Q9D2H8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc8Q9D2H8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc8Q9D2H8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc8Q9D2H8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc8Q9D2H8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc8Q9D2H8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc8Q9D2H8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc8Q9D2H8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc8Q9D2H8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc8Q9D2H8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc8Q9D2H8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc8Q9D2H8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc8Q9D2H8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc8Q9D2H8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc8Q9D2H8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc8Q9D2H8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc8Q9D2H8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fndc8Q9D2H8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc8Q9D2H8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc8Q9D2H8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc8Q9D2H8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc8Q9D2H8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc8Q9D2H8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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