Protein–RNA interactions for Protein: Q9D139

Lce1e, Late cornified envelope 1E, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce1eQ9D139 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lce1eQ9D139 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lce1eQ9D139 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lce1eQ9D139 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lce1eQ9D139 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lce1eQ9D139 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lce1eQ9D139 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lce1eQ9D139 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lce1eQ9D139 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lce1eQ9D139 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lce1eQ9D139 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lce1eQ9D139 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lce1eQ9D139 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lce1eQ9D139 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lce1eQ9D139 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lce1eQ9D139 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Lce1eQ9D139 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lce1eQ9D139 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lce1eQ9D139 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lce1eQ9D139 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lce1eQ9D139 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lce1eQ9D139 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lce1eQ9D139 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lce1eQ9D139 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lce1eQ9D139 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lce1eQ9D139 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lce1eQ9D139 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lce1eQ9D139 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lce1eQ9D139 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lce1eQ9D139 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lce1eQ9D139 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lce1eQ9D139 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lce1eQ9D139 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms