Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem53Q9D0Z3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem53Q9D0Z3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem53Q9D0Z3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tmem53Q9D0Z3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmem53Q9D0Z3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem53Q9D0Z3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmem53Q9D0Z3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem53Q9D0Z3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem53Q9D0Z3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmem53Q9D0Z3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmem53Q9D0Z3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem53Q9D0Z3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem53Q9D0Z3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem53Q9D0Z3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem53Q9D0Z3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem53Q9D0Z3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem53Q9D0Z3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem53Q9D0Z3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem53Q9D0Z3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem53Q9D0Z3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem53Q9D0Z3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem53Q9D0Z3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem53Q9D0Z3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem53Q9D0Z3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem53Q9D0Z3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem53Q9D0Z3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem53Q9D0Z3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem53Q9D0Z3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem53Q9D0Z3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem53Q9D0Z3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem53Q9D0Z3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem53Q9D0Z3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem53Q9D0Z3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem53Q9D0Z3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem53Q9D0Z3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem53Q9D0Z3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem53Q9D0Z3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem53Q9D0Z3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem53Q9D0Z3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem53Q9D0Z3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem53Q9D0Z3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem53Q9D0Z3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem53Q9D0Z3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem53Q9D0Z3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem53Q9D0Z3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem53Q9D0Z3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem53Q9D0Z3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem53Q9D0Z3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem53Q9D0Z3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem53Q9D0Z3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem53Q9D0Z3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem53Q9D0Z3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem53Q9D0Z3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem53Q9D0Z3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem53Q9D0Z3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem53Q9D0Z3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem53Q9D0Z3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem53Q9D0Z3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem53Q9D0Z3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem53Q9D0Z3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem53Q9D0Z3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem53Q9D0Z3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem53Q9D0Z3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem53Q9D0Z3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem53Q9D0Z3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem53Q9D0Z3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem53Q9D0Z3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem53Q9D0Z3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem53Q9D0Z3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem53Q9D0Z3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem53Q9D0Z3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem53Q9D0Z3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem53Q9D0Z3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem53Q9D0Z3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem53Q9D0Z3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem53Q9D0Z3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem53Q9D0Z3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem53Q9D0Z3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem53Q9D0Z3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem53Q9D0Z3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem53Q9D0Z3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem53Q9D0Z3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem53Q9D0Z3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem53Q9D0Z3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem53Q9D0Z3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem53Q9D0Z3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem53Q9D0Z3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem53Q9D0Z3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem53Q9D0Z3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms