Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdhdQ9CXV1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SdhdQ9CXV1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SdhdQ9CXV1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SdhdQ9CXV1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SdhdQ9CXV1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SdhdQ9CXV1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SdhdQ9CXV1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SdhdQ9CXV1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SdhdQ9CXV1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SdhdQ9CXV1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SdhdQ9CXV1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SdhdQ9CXV1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SdhdQ9CXV1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SdhdQ9CXV1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SdhdQ9CXV1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SdhdQ9CXV1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SdhdQ9CXV1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SdhdQ9CXV1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SdhdQ9CXV1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdhdQ9CXV1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhdQ9CXV1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdhdQ9CXV1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdhdQ9CXV1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SdhdQ9CXV1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SdhdQ9CXV1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SdhdQ9CXV1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SdhdQ9CXV1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SdhdQ9CXV1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdhdQ9CXV1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdhdQ9CXV1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdhdQ9CXV1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdhdQ9CXV1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SdhdQ9CXV1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SdhdQ9CXV1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SdhdQ9CXV1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhdQ9CXV1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SdhdQ9CXV1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SdhdQ9CXV1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SdhdQ9CXV1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SdhdQ9CXV1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SdhdQ9CXV1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SdhdQ9CXV1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SdhdQ9CXV1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SdhdQ9CXV1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SdhdQ9CXV1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SdhdQ9CXV1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SdhdQ9CXV1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhdQ9CXV1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhdQ9CXV1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhdQ9CXV1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SdhdQ9CXV1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SdhdQ9CXV1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SdhdQ9CXV1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhdQ9CXV1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SdhdQ9CXV1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SdhdQ9CXV1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhdQ9CXV1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SdhdQ9CXV1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SdhdQ9CXV1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SdhdQ9CXV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SdhdQ9CXV1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SdhdQ9CXV1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhdQ9CXV1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhdQ9CXV1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SdhdQ9CXV1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdhdQ9CXV1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SdhdQ9CXV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SdhdQ9CXV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SdhdQ9CXV1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SdhdQ9CXV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SdhdQ9CXV1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SdhdQ9CXV1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SdhdQ9CXV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SdhdQ9CXV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SdhdQ9CXV1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SdhdQ9CXV1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SdhdQ9CXV1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SdhdQ9CXV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SdhdQ9CXV1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SdhdQ9CXV1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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