Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY3

Setd6, N-lysine methyltransferase SETD6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd6Q9CWY3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setd6Q9CWY3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd6Q9CWY3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd6Q9CWY3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Setd6Q9CWY3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setd6Q9CWY3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setd6Q9CWY3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setd6Q9CWY3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd6Q9CWY3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd6Q9CWY3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd6Q9CWY3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd6Q9CWY3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd6Q9CWY3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd6Q9CWY3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd6Q9CWY3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd6Q9CWY3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd6Q9CWY3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd6Q9CWY3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Setd6Q9CWY3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd6Q9CWY3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd6Q9CWY3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd6Q9CWY3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd6Q9CWY3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd6Q9CWY3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd6Q9CWY3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd6Q9CWY3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd6Q9CWY3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd6Q9CWY3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd6Q9CWY3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd6Q9CWY3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd6Q9CWY3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd6Q9CWY3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd6Q9CWY3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd6Q9CWY3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd6Q9CWY3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd6Q9CWY3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd6Q9CWY3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd6Q9CWY3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd6Q9CWY3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Setd6Q9CWY3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd6Q9CWY3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Setd6Q9CWY3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Setd6Q9CWY3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Setd6Q9CWY3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Setd6Q9CWY3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Setd6Q9CWY3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Setd6Q9CWY3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Setd6Q9CWY3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd6Q9CWY3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd6Q9CWY3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd6Q9CWY3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Setd6Q9CWY3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Setd6Q9CWY3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Setd6Q9CWY3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Setd6Q9CWY3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Setd6Q9CWY3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Setd6Q9CWY3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Setd6Q9CWY3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Setd6Q9CWY3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Setd6Q9CWY3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setd6Q9CWY3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Setd6Q9CWY3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd6Q9CWY3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd6Q9CWY3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd6Q9CWY3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd6Q9CWY3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd6Q9CWY3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd6Q9CWY3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd6Q9CWY3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd6Q9CWY3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd6Q9CWY3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd6Q9CWY3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd6Q9CWY3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Setd6Q9CWY3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd6Q9CWY3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setd6Q9CWY3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setd6Q9CWY3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Setd6Q9CWY3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Setd6Q9CWY3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setd6Q9CWY3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setd6Q9CWY3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setd6Q9CWY3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setd6Q9CWY3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setd6Q9CWY3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setd6Q9CWY3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setd6Q9CWY3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Setd6Q9CWY3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd6Q9CWY3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd6Q9CWY3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd6Q9CWY3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd6Q9CWY3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 785.3 ms