Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx47Q9CWX9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddx47Q9CWX9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ddx47Q9CWX9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx47Q9CWX9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddx47Q9CWX9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddx47Q9CWX9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx47Q9CWX9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddx47Q9CWX9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx47Q9CWX9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx47Q9CWX9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx47Q9CWX9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx47Q9CWX9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx47Q9CWX9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddx47Q9CWX9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddx47Q9CWX9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx47Q9CWX9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ddx47Q9CWX9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddx47Q9CWX9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx47Q9CWX9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx47Q9CWX9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx47Q9CWX9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddx47Q9CWX9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx47Q9CWX9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx47Q9CWX9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx47Q9CWX9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx47Q9CWX9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx47Q9CWX9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx47Q9CWX9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx47Q9CWX9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx47Q9CWX9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx47Q9CWX9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx47Q9CWX9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx47Q9CWX9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx47Q9CWX9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx47Q9CWX9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx47Q9CWX9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx47Q9CWX9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx47Q9CWX9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx47Q9CWX9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ddx47Q9CWX9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx47Q9CWX9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx47Q9CWX9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx47Q9CWX9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx47Q9CWX9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx47Q9CWX9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx47Q9CWX9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx47Q9CWX9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx47Q9CWX9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx47Q9CWX9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx47Q9CWX9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx47Q9CWX9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx47Q9CWX9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx47Q9CWX9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx47Q9CWX9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx47Q9CWX9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx47Q9CWX9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx47Q9CWX9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx47Q9CWX9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx47Q9CWX9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx47Q9CWX9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx47Q9CWX9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx47Q9CWX9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx47Q9CWX9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx47Q9CWX9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx47Q9CWX9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx47Q9CWX9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx47Q9CWX9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx47Q9CWX9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx47Q9CWX9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx47Q9CWX9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx47Q9CWX9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx47Q9CWX9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx47Q9CWX9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx47Q9CWX9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx47Q9CWX9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx47Q9CWX9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx47Q9CWX9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx47Q9CWX9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx47Q9CWX9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx47Q9CWX9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx47Q9CWX9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx47Q9CWX9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx47Q9CWX9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx47Q9CWX9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx47Q9CWX9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx47Q9CWX9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx47Q9CWX9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ddx47Q9CWX9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ddx47Q9CWX9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddx47Q9CWX9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddx47Q9CWX9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx47Q9CWX9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddx47Q9CWX9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx47Q9CWX9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx47Q9CWX9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx47Q9CWX9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx47Q9CWX9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx47Q9CWX9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx47Q9CWX9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms