Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930535I16RikQ9CUI2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930535I16RikQ9CUI2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930535I16RikQ9CUI2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930535I16RikQ9CUI2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930535I16RikQ9CUI2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930535I16RikQ9CUI2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930535I16RikQ9CUI2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930535I16RikQ9CUI2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4930535I16RikQ9CUI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930535I16RikQ9CUI2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930535I16RikQ9CUI2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms