Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Chchd3Q9CRB9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Chchd3Q9CRB9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chchd3Q9CRB9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chchd3Q9CRB9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chchd3Q9CRB9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chchd3Q9CRB9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chchd3Q9CRB9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chchd3Q9CRB9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chchd3Q9CRB9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chchd3Q9CRB9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chchd3Q9CRB9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chchd3Q9CRB9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chchd3Q9CRB9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chchd3Q9CRB9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Chchd3Q9CRB9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chchd3Q9CRB9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chchd3Q9CRB9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chchd3Q9CRB9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chchd3Q9CRB9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chchd3Q9CRB9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chchd3Q9CRB9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chchd3Q9CRB9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chchd3Q9CRB9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chchd3Q9CRB9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chchd3Q9CRB9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chchd3Q9CRB9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chchd3Q9CRB9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chchd3Q9CRB9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chchd3Q9CRB9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chchd3Q9CRB9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chchd3Q9CRB9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chchd3Q9CRB9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chchd3Q9CRB9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chchd3Q9CRB9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chchd3Q9CRB9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Chchd3Q9CRB9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chchd3Q9CRB9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Chchd3Q9CRB9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chchd3Q9CRB9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chchd3Q9CRB9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chchd3Q9CRB9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Chchd3Q9CRB9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chchd3Q9CRB9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chchd3Q9CRB9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chchd3Q9CRB9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chchd3Q9CRB9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chchd3Q9CRB9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chchd3Q9CRB9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Chchd3Q9CRB9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chchd3Q9CRB9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chchd3Q9CRB9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chchd3Q9CRB9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chchd3Q9CRB9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chchd3Q9CRB9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chchd3Q9CRB9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chchd3Q9CRB9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chchd3Q9CRB9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chchd3Q9CRB9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chchd3Q9CRB9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Chchd3Q9CRB9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chchd3Q9CRB9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chchd3Q9CRB9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chchd3Q9CRB9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chchd3Q9CRB9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chchd3Q9CRB9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chchd3Q9CRB9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chchd3Q9CRB9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chchd3Q9CRB9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chchd3Q9CRB9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chchd3Q9CRB9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chchd3Q9CRB9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chchd3Q9CRB9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chchd3Q9CRB9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chchd3Q9CRB9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chchd3Q9CRB9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chchd3Q9CRB9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chchd3Q9CRB9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chchd3Q9CRB9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chchd3Q9CRB9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chchd3Q9CRB9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chchd3Q9CRB9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chchd3Q9CRB9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chchd3Q9CRB9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chchd3Q9CRB9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chchd3Q9CRB9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chchd3Q9CRB9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chchd3Q9CRB9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chchd3Q9CRB9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chchd3Q9CRB9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chchd3Q9CRB9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341 ms