Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkiras2Q9CR56 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkiras2Q9CR56 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkiras2Q9CR56 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkiras2Q9CR56 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkiras2Q9CR56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkiras2Q9CR56 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkiras2Q9CR56 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkiras2Q9CR56 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkiras2Q9CR56 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkiras2Q9CR56 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkiras2Q9CR56 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkiras2Q9CR56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkiras2Q9CR56 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkiras2Q9CR56 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkiras2Q9CR56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkiras2Q9CR56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkiras2Q9CR56 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkiras2Q9CR56 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkiras2Q9CR56 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkiras2Q9CR56 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkiras2Q9CR56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkiras2Q9CR56 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkiras2Q9CR56 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nkiras2Q9CR56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkiras2Q9CR56 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkiras2Q9CR56 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkiras2Q9CR56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkiras2Q9CR56 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkiras2Q9CR56 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkiras2Q9CR56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkiras2Q9CR56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkiras2Q9CR56 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkiras2Q9CR56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkiras2Q9CR56 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkiras2Q9CR56 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkiras2Q9CR56 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkiras2Q9CR56 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkiras2Q9CR56 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkiras2Q9CR56 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkiras2Q9CR56 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkiras2Q9CR56 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkiras2Q9CR56 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkiras2Q9CR56 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkiras2Q9CR56 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkiras2Q9CR56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkiras2Q9CR56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkiras2Q9CR56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkiras2Q9CR56 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkiras2Q9CR56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkiras2Q9CR56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkiras2Q9CR56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkiras2Q9CR56 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkiras2Q9CR56 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkiras2Q9CR56 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkiras2Q9CR56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkiras2Q9CR56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkiras2Q9CR56 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkiras2Q9CR56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkiras2Q9CR56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkiras2Q9CR56 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkiras2Q9CR56 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkiras2Q9CR56 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkiras2Q9CR56 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkiras2Q9CR56 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkiras2Q9CR56 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nkiras2Q9CR56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkiras2Q9CR56 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkiras2Q9CR56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkiras2Q9CR56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkiras2Q9CR56 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkiras2Q9CR56 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkiras2Q9CR56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkiras2Q9CR56 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkiras2Q9CR56 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkiras2Q9CR56 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkiras2Q9CR56 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkiras2Q9CR56 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkiras2Q9CR56 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkiras2Q9CR56 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkiras2Q9CR56 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkiras2Q9CR56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkiras2Q9CR56 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkiras2Q9CR56 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkiras2Q9CR56 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkiras2Q9CR56 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkiras2Q9CR56 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkiras2Q9CR56 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkiras2Q9CR56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkiras2Q9CR56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkiras2Q9CR56 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkiras2Q9CR56 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkiras2Q9CR56 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkiras2Q9CR56 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkiras2Q9CR56 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkiras2Q9CR56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkiras2Q9CR56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkiras2Q9CR56 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkiras2Q9CR56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkiras2Q9CR56 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms