Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NmbQ9CR53 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NmbQ9CR53 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NmbQ9CR53 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NmbQ9CR53 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NmbQ9CR53 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NmbQ9CR53 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NmbQ9CR53 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NmbQ9CR53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NmbQ9CR53 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NmbQ9CR53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NmbQ9CR53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NmbQ9CR53 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NmbQ9CR53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NmbQ9CR53 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NmbQ9CR53 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NmbQ9CR53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NmbQ9CR53 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NmbQ9CR53 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NmbQ9CR53 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NmbQ9CR53 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NmbQ9CR53 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NmbQ9CR53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NmbQ9CR53 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NmbQ9CR53 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NmbQ9CR53 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NmbQ9CR53 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NmbQ9CR53 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NmbQ9CR53 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NmbQ9CR53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NmbQ9CR53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NmbQ9CR53 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmbQ9CR53 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmbQ9CR53 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmbQ9CR53 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmbQ9CR53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NmbQ9CR53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmbQ9CR53 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmbQ9CR53 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NmbQ9CR53 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NmbQ9CR53 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NmbQ9CR53 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NmbQ9CR53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NmbQ9CR53 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NmbQ9CR53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NmbQ9CR53 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NmbQ9CR53 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NmbQ9CR53 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NmbQ9CR53 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NmbQ9CR53 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmbQ9CR53 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmbQ9CR53 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NmbQ9CR53 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmbQ9CR53 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NmbQ9CR53 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NmbQ9CR53 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NmbQ9CR53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NmbQ9CR53 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NmbQ9CR53 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NmbQ9CR53 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NmbQ9CR53 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NmbQ9CR53 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NmbQ9CR53 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NmbQ9CR53 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NmbQ9CR53 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NmbQ9CR53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NmbQ9CR53 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NmbQ9CR53 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NmbQ9CR53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NmbQ9CR53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NmbQ9CR53 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NmbQ9CR53 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NmbQ9CR53 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NmbQ9CR53 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NmbQ9CR53 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NmbQ9CR53 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NmbQ9CR53 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NmbQ9CR53 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NmbQ9CR53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NmbQ9CR53 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NmbQ9CR53 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NmbQ9CR53 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NmbQ9CR53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NmbQ9CR53 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NmbQ9CR53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NmbQ9CR53 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NmbQ9CR53 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NmbQ9CR53 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NmbQ9CR53 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NmbQ9CR53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbQ9CR53 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms