Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Med4Q9CQA5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Med4Q9CQA5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Med4Q9CQA5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Med4Q9CQA5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Med4Q9CQA5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Med4Q9CQA5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Med4Q9CQA5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Med4Q9CQA5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Med4Q9CQA5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Med4Q9CQA5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Med4Q9CQA5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Med4Q9CQA5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Med4Q9CQA5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Med4Q9CQA5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Med4Q9CQA5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Med4Q9CQA5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Med4Q9CQA5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Med4Q9CQA5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Med4Q9CQA5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Med4Q9CQA5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Med4Q9CQA5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Med4Q9CQA5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Med4Q9CQA5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Med4Q9CQA5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Med4Q9CQA5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Med4Q9CQA5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Med4Q9CQA5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Med4Q9CQA5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Med4Q9CQA5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Med4Q9CQA5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Med4Q9CQA5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Med4Q9CQA5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Med4Q9CQA5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Med4Q9CQA5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Med4Q9CQA5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Med4Q9CQA5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Med4Q9CQA5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Med4Q9CQA5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Med4Q9CQA5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Med4Q9CQA5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Med4Q9CQA5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Med4Q9CQA5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Med4Q9CQA5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Med4Q9CQA5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Med4Q9CQA5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Med4Q9CQA5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Med4Q9CQA5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Med4Q9CQA5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Med4Q9CQA5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Med4Q9CQA5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Med4Q9CQA5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Med4Q9CQA5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Med4Q9CQA5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Med4Q9CQA5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Med4Q9CQA5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Med4Q9CQA5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Med4Q9CQA5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Med4Q9CQA5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Med4Q9CQA5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Med4Q9CQA5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Med4Q9CQA5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Med4Q9CQA5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Med4Q9CQA5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Med4Q9CQA5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Med4Q9CQA5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Med4Q9CQA5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Med4Q9CQA5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Med4Q9CQA5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Med4Q9CQA5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Med4Q9CQA5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Med4Q9CQA5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Med4Q9CQA5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Med4Q9CQA5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Med4Q9CQA5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Med4Q9CQA5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Med4Q9CQA5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Med4Q9CQA5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Med4Q9CQA5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Med4Q9CQA5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Med4Q9CQA5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Med4Q9CQA5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Med4Q9CQA5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Med4Q9CQA5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Med4Q9CQA5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Med4Q9CQA5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Med4Q9CQA5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Med4Q9CQA5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Med4Q9CQA5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Med4Q9CQA5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Med4Q9CQA5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms