Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NepnQ9CQ76 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NepnQ9CQ76 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NepnQ9CQ76 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NepnQ9CQ76 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NepnQ9CQ76 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NepnQ9CQ76 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NepnQ9CQ76 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NepnQ9CQ76 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NepnQ9CQ76 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NepnQ9CQ76 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NepnQ9CQ76 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NepnQ9CQ76 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NepnQ9CQ76 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NepnQ9CQ76 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NepnQ9CQ76 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NepnQ9CQ76 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NepnQ9CQ76 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NepnQ9CQ76 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NepnQ9CQ76 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NepnQ9CQ76 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NepnQ9CQ76 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NepnQ9CQ76 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NepnQ9CQ76 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NepnQ9CQ76 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NepnQ9CQ76 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NepnQ9CQ76 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NepnQ9CQ76 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NepnQ9CQ76 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NepnQ9CQ76 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NepnQ9CQ76 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NepnQ9CQ76 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NepnQ9CQ76 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NepnQ9CQ76 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NepnQ9CQ76 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NepnQ9CQ76 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NepnQ9CQ76 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NepnQ9CQ76 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NepnQ9CQ76 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NepnQ9CQ76 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NepnQ9CQ76 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NepnQ9CQ76 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NepnQ9CQ76 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NepnQ9CQ76 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NepnQ9CQ76 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NepnQ9CQ76 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NepnQ9CQ76 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NepnQ9CQ76 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NepnQ9CQ76 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NepnQ9CQ76 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NepnQ9CQ76 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NepnQ9CQ76 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NepnQ9CQ76 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NepnQ9CQ76 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NepnQ9CQ76 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NepnQ9CQ76 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NepnQ9CQ76 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NepnQ9CQ76 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NepnQ9CQ76 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NepnQ9CQ76 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NepnQ9CQ76 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NepnQ9CQ76 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NepnQ9CQ76 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NepnQ9CQ76 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NepnQ9CQ76 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NepnQ9CQ76 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NepnQ9CQ76 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NepnQ9CQ76 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NepnQ9CQ76 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NepnQ9CQ76 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NepnQ9CQ76 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NepnQ9CQ76 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NepnQ9CQ76 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NepnQ9CQ76 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NepnQ9CQ76 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NepnQ9CQ76 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NepnQ9CQ76 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NepnQ9CQ76 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NepnQ9CQ76 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NepnQ9CQ76 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NepnQ9CQ76 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NepnQ9CQ76 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NepnQ9CQ76 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NepnQ9CQ76 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NepnQ9CQ76 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NepnQ9CQ76 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NepnQ9CQ76 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NepnQ9CQ76 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NepnQ9CQ76 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NepnQ9CQ76 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms