Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk2ap2Q9CPY4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk2ap2Q9CPY4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk2ap2Q9CPY4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk2ap2Q9CPY4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk2ap2Q9CPY4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk2ap2Q9CPY4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk2ap2Q9CPY4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk2ap2Q9CPY4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk2ap2Q9CPY4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk2ap2Q9CPY4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk2ap2Q9CPY4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk2ap2Q9CPY4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk2ap2Q9CPY4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk2ap2Q9CPY4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk2ap2Q9CPY4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk2ap2Q9CPY4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk2ap2Q9CPY4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk2ap2Q9CPY4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk2ap2Q9CPY4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk2ap2Q9CPY4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk2ap2Q9CPY4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk2ap2Q9CPY4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk2ap2Q9CPY4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk2ap2Q9CPY4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk2ap2Q9CPY4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk2ap2Q9CPY4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk2ap2Q9CPY4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk2ap2Q9CPY4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk2ap2Q9CPY4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk2ap2Q9CPY4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk2ap2Q9CPY4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk2ap2Q9CPY4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk2ap2Q9CPY4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk2ap2Q9CPY4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk2ap2Q9CPY4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk2ap2Q9CPY4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk2ap2Q9CPY4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk2ap2Q9CPY4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk2ap2Q9CPY4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk2ap2Q9CPY4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk2ap2Q9CPY4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk2ap2Q9CPY4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk2ap2Q9CPY4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk2ap2Q9CPY4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk2ap2Q9CPY4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk2ap2Q9CPY4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk2ap2Q9CPY4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk2ap2Q9CPY4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk2ap2Q9CPY4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk2ap2Q9CPY4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk2ap2Q9CPY4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk2ap2Q9CPY4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk2ap2Q9CPY4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdk2ap2Q9CPY4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdk2ap2Q9CPY4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdk2ap2Q9CPY4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk2ap2Q9CPY4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdk2ap2Q9CPY4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk2ap2Q9CPY4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk2ap2Q9CPY4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk2ap2Q9CPY4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk2ap2Q9CPY4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk2ap2Q9CPY4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk2ap2Q9CPY4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms