Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Acss1Q99NB1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Acss1Q99NB1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Acss1Q99NB1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Acss1Q99NB1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Acss1Q99NB1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Acss1Q99NB1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Acss1Q99NB1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Acss1Q99NB1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Acss1Q99NB1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Acss1Q99NB1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Acss1Q99NB1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Acss1Q99NB1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Acss1Q99NB1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Acss1Q99NB1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Acss1Q99NB1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Acss1Q99NB1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Acss1Q99NB1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Acss1Q99NB1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Acss1Q99NB1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Acss1Q99NB1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Acss1Q99NB1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Acss1Q99NB1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Acss1Q99NB1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Acss1Q99NB1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Acss1Q99NB1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Acss1Q99NB1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Acss1Q99NB1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Acss1Q99NB1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Acss1Q99NB1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Acss1Q99NB1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acss1Q99NB1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acss1Q99NB1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Acss1Q99NB1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Acss1Q99NB1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Acss1Q99NB1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Acss1Q99NB1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Acss1Q99NB1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Acss1Q99NB1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Acss1Q99NB1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Acss1Q99NB1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Acss1Q99NB1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Acss1Q99NB1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Acss1Q99NB1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Acss1Q99NB1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Acss1Q99NB1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Acss1Q99NB1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Acss1Q99NB1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Acss1Q99NB1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Acss1Q99NB1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Acss1Q99NB1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Acss1Q99NB1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Acss1Q99NB1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Acss1Q99NB1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Acss1Q99NB1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Acss1Q99NB1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Acss1Q99NB1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Acss1Q99NB1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Acss1Q99NB1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Acss1Q99NB1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Acss1Q99NB1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Acss1Q99NB1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Acss1Q99NB1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Acss1Q99NB1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Acss1Q99NB1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Acss1Q99NB1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Acss1Q99NB1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Acss1Q99NB1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Acss1Q99NB1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Acss1Q99NB1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Acss1Q99NB1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Acss1Q99NB1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acss1Q99NB1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acss1Q99NB1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acss1Q99NB1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Acss1Q99NB1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acss1Q99NB1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acss1Q99NB1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acss1Q99NB1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acss1Q99NB1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acss1Q99NB1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acss1Q99NB1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acss1Q99NB1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acss1Q99NB1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Acss1Q99NB1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Acss1Q99NB1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acss1Q99NB1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acss1Q99NB1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Acss1Q99NB1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Acss1Q99NB1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Acss1Q99NB1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Acss1Q99NB1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Acss1Q99NB1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Acss1Q99NB1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Acss1Q99NB1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Acss1Q99NB1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acss1Q99NB1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Acss1Q99NB1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Acss1Q99NB1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Acss1Q99NB1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms