Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS1

Mmadhc, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type D homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MmadhcQ99LS1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MmadhcQ99LS1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MmadhcQ99LS1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MmadhcQ99LS1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MmadhcQ99LS1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MmadhcQ99LS1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MmadhcQ99LS1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MmadhcQ99LS1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MmadhcQ99LS1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MmadhcQ99LS1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MmadhcQ99LS1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MmadhcQ99LS1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MmadhcQ99LS1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MmadhcQ99LS1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MmadhcQ99LS1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MmadhcQ99LS1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MmadhcQ99LS1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MmadhcQ99LS1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MmadhcQ99LS1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MmadhcQ99LS1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MmadhcQ99LS1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MmadhcQ99LS1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MmadhcQ99LS1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MmadhcQ99LS1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MmadhcQ99LS1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MmadhcQ99LS1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MmadhcQ99LS1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MmadhcQ99LS1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MmadhcQ99LS1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MmadhcQ99LS1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MmadhcQ99LS1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MmadhcQ99LS1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MmadhcQ99LS1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MmadhcQ99LS1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MmadhcQ99LS1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MmadhcQ99LS1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MmadhcQ99LS1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MmadhcQ99LS1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MmadhcQ99LS1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MmadhcQ99LS1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MmadhcQ99LS1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MmadhcQ99LS1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MmadhcQ99LS1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MmadhcQ99LS1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MmadhcQ99LS1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MmadhcQ99LS1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MmadhcQ99LS1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MmadhcQ99LS1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MmadhcQ99LS1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MmadhcQ99LS1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MmadhcQ99LS1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MmadhcQ99LS1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MmadhcQ99LS1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MmadhcQ99LS1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MmadhcQ99LS1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MmadhcQ99LS1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MmadhcQ99LS1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MmadhcQ99LS1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MmadhcQ99LS1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MmadhcQ99LS1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MmadhcQ99LS1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MmadhcQ99LS1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MmadhcQ99LS1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MmadhcQ99LS1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MmadhcQ99LS1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MmadhcQ99LS1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MmadhcQ99LS1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MmadhcQ99LS1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MmadhcQ99LS1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MmadhcQ99LS1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MmadhcQ99LS1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MmadhcQ99LS1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MmadhcQ99LS1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MmadhcQ99LS1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MmadhcQ99LS1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MmadhcQ99LS1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MmadhcQ99LS1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MmadhcQ99LS1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MmadhcQ99LS1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MmadhcQ99LS1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MmadhcQ99LS1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MmadhcQ99LS1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MmadhcQ99LS1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MmadhcQ99LS1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MmadhcQ99LS1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MmadhcQ99LS1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MmadhcQ99LS1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MmadhcQ99LS1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MmadhcQ99LS1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MmadhcQ99LS1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MmadhcQ99LS1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MmadhcQ99LS1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MmadhcQ99LS1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MmadhcQ99LS1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MmadhcQ99LS1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MmadhcQ99LS1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MmadhcQ99LS1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MmadhcQ99LS1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MmadhcQ99LS1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MmadhcQ99LS1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms