Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS0

Ecrg4, Augurin, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecrg4Q99LS0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecrg4Q99LS0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ecrg4Q99LS0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecrg4Q99LS0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecrg4Q99LS0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecrg4Q99LS0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecrg4Q99LS0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecrg4Q99LS0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecrg4Q99LS0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecrg4Q99LS0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecrg4Q99LS0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecrg4Q99LS0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecrg4Q99LS0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecrg4Q99LS0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ecrg4Q99LS0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ecrg4Q99LS0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ecrg4Q99LS0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ecrg4Q99LS0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ecrg4Q99LS0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ecrg4Q99LS0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ecrg4Q99LS0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ecrg4Q99LS0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ecrg4Q99LS0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ecrg4Q99LS0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ecrg4Q99LS0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecrg4Q99LS0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecrg4Q99LS0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecrg4Q99LS0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecrg4Q99LS0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecrg4Q99LS0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecrg4Q99LS0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecrg4Q99LS0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecrg4Q99LS0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ecrg4Q99LS0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecrg4Q99LS0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecrg4Q99LS0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecrg4Q99LS0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecrg4Q99LS0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ecrg4Q99LS0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ecrg4Q99LS0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ecrg4Q99LS0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ecrg4Q99LS0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecrg4Q99LS0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecrg4Q99LS0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecrg4Q99LS0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecrg4Q99LS0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ecrg4Q99LS0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ecrg4Q99LS0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ecrg4Q99LS0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecrg4Q99LS0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecrg4Q99LS0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ecrg4Q99LS0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecrg4Q99LS0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecrg4Q99LS0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecrg4Q99LS0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecrg4Q99LS0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecrg4Q99LS0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecrg4Q99LS0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ecrg4Q99LS0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecrg4Q99LS0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecrg4Q99LS0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecrg4Q99LS0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecrg4Q99LS0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecrg4Q99LS0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecrg4Q99LS0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecrg4Q99LS0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecrg4Q99LS0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecrg4Q99LS0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecrg4Q99LS0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecrg4Q99LS0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ecrg4Q99LS0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ecrg4Q99LS0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ecrg4Q99LS0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ecrg4Q99LS0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ecrg4Q99LS0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ecrg4Q99LS0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ecrg4Q99LS0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ecrg4Q99LS0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecrg4Q99LS0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ecrg4Q99LS0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecrg4Q99LS0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecrg4Q99LS0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ecrg4Q99LS0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecrg4Q99LS0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecrg4Q99LS0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ecrg4Q99LS0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecrg4Q99LS0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecrg4Q99LS0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecrg4Q99LS0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecrg4Q99LS0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecrg4Q99LS0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms