Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sntg1Q925E1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sntg1Q925E1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sntg1Q925E1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sntg1Q925E1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sntg1Q925E1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sntg1Q925E1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sntg1Q925E1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sntg1Q925E1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sntg1Q925E1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sntg1Q925E1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sntg1Q925E1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sntg1Q925E1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sntg1Q925E1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sntg1Q925E1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sntg1Q925E1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sntg1Q925E1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sntg1Q925E1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sntg1Q925E1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sntg1Q925E1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sntg1Q925E1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sntg1Q925E1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sntg1Q925E1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sntg1Q925E1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sntg1Q925E1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sntg1Q925E1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sntg1Q925E1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sntg1Q925E1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sntg1Q925E1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sntg1Q925E1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sntg1Q925E1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sntg1Q925E1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sntg1Q925E1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sntg1Q925E1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sntg1Q925E1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sntg1Q925E1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sntg1Q925E1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sntg1Q925E1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sntg1Q925E1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sntg1Q925E1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sntg1Q925E1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sntg1Q925E1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sntg1Q925E1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sntg1Q925E1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sntg1Q925E1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sntg1Q925E1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sntg1Q925E1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sntg1Q925E1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sntg1Q925E1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sntg1Q925E1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sntg1Q925E1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sntg1Q925E1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sntg1Q925E1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sntg1Q925E1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sntg1Q925E1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sntg1Q925E1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sntg1Q925E1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sntg1Q925E1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sntg1Q925E1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sntg1Q925E1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sntg1Q925E1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sntg1Q925E1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sntg1Q925E1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sntg1Q925E1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sntg1Q925E1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg1Q925E1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg1Q925E1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg1Q925E1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sntg1Q925E1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sntg1Q925E1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sntg1Q925E1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sntg1Q925E1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sntg1Q925E1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sntg1Q925E1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sntg1Q925E1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sntg1Q925E1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sntg1Q925E1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sntg1Q925E1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sntg1Q925E1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sntg1Q925E1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sntg1Q925E1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sntg1Q925E1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sntg1Q925E1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sntg1Q925E1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms