Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx18Q91ZR2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx18Q91ZR2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx18Q91ZR2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx18Q91ZR2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx18Q91ZR2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx18Q91ZR2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx18Q91ZR2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx18Q91ZR2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx18Q91ZR2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx18Q91ZR2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx18Q91ZR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx18Q91ZR2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx18Q91ZR2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx18Q91ZR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx18Q91ZR2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx18Q91ZR2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx18Q91ZR2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx18Q91ZR2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx18Q91ZR2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx18Q91ZR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx18Q91ZR2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx18Q91ZR2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx18Q91ZR2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx18Q91ZR2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx18Q91ZR2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx18Q91ZR2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx18Q91ZR2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx18Q91ZR2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx18Q91ZR2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx18Q91ZR2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx18Q91ZR2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx18Q91ZR2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx18Q91ZR2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx18Q91ZR2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx18Q91ZR2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx18Q91ZR2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx18Q91ZR2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx18Q91ZR2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx18Q91ZR2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx18Q91ZR2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx18Q91ZR2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx18Q91ZR2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx18Q91ZR2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx18Q91ZR2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx18Q91ZR2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx18Q91ZR2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx18Q91ZR2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx18Q91ZR2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx18Q91ZR2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx18Q91ZR2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx18Q91ZR2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx18Q91ZR2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx18Q91ZR2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx18Q91ZR2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx18Q91ZR2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx18Q91ZR2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx18Q91ZR2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx18Q91ZR2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx18Q91ZR2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx18Q91ZR2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx18Q91ZR2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx18Q91ZR2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx18Q91ZR2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx18Q91ZR2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx18Q91ZR2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx18Q91ZR2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx18Q91ZR2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx18Q91ZR2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx18Q91ZR2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx18Q91ZR2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx18Q91ZR2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms